More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2724 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  100 
 
 
266 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  63.53 
 
 
272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  61.22 
 
 
288 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  61.28 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  62.03 
 
 
275 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  61.28 
 
 
276 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  56.98 
 
 
278 aa  314  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  58.87 
 
 
278 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  48.66 
 
 
273 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  48.11 
 
 
267 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  53.23 
 
 
275 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  53.23 
 
 
275 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  48.3 
 
 
274 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  48.5 
 
 
267 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  54.2 
 
 
259 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  54.2 
 
 
259 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  54.2 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  53.11 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  53.94 
 
 
272 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  45 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  53.49 
 
 
276 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  46.36 
 
 
270 aa  249  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  50.92 
 
 
282 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  46.56 
 
 
269 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  48.7 
 
 
272 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  49.06 
 
 
271 aa  245  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  52.69 
 
 
265 aa  245  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  53.61 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  46.95 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  51.29 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  50.73 
 
 
285 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  44.4 
 
 
268 aa  241  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  53.82 
 
 
259 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  48.24 
 
 
291 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  48.03 
 
 
280 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  45.83 
 
 
264 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  48.03 
 
 
280 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  47.2 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  45.08 
 
 
267 aa  231  9e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  48.48 
 
 
264 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  45.21 
 
 
258 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  44.7 
 
 
269 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  44.7 
 
 
269 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  44.7 
 
 
269 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  44.7 
 
 
267 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  44.7 
 
 
269 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  44.32 
 
 
269 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  44.32 
 
 
269 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  44.32 
 
 
269 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  44.32 
 
 
269 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  43.94 
 
 
269 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  45.98 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  45.38 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  52.75 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  44.87 
 
 
281 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  44.49 
 
 
281 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  43.85 
 
 
278 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  42.09 
 
 
295 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  45.69 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  44.27 
 
 
265 aa  214  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  41.95 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  47.29 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  41.79 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  45.36 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  46.82 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  41.04 
 
 
271 aa  211  9e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  47.1 
 
 
270 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  48.8 
 
 
301 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  45.72 
 
 
281 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  44.15 
 
 
261 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  46.92 
 
 
282 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  43.82 
 
 
276 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  45.28 
 
 
285 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  46.99 
 
 
263 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  47.94 
 
 
279 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  45.1 
 
 
289 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  47.57 
 
 
310 aa  205  7e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  48.85 
 
 
268 aa  205  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  47.57 
 
 
279 aa  205  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  41.44 
 
 
270 aa  204  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  43.24 
 
 
295 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  48.02 
 
 
264 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  43.4 
 
 
266 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  43.4 
 
 
266 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  42.48 
 
 
267 aa  201  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  46.27 
 
 
276 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  45.08 
 
 
295 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  49.44 
 
 
268 aa  198  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  45.86 
 
 
360 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  45.98 
 
 
271 aa  198  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  46.27 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  47.43 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  46.27 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  46.21 
 
 
280 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  46.21 
 
 
280 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  42.2 
 
 
307 aa  193  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  45.45 
 
 
276 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  37.69 
 
 
264 aa  191  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  45.38 
 
 
265 aa  191  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  37.22 
 
 
271 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>