More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0680 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  100 
 
 
281 aa  583  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  41.13 
 
 
291 aa  225  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  41.29 
 
 
264 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  40.61 
 
 
264 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  39.93 
 
 
264 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  39.43 
 
 
271 aa  202  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  36.33 
 
 
271 aa  199  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  37.09 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  37.82 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  37.82 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  37.82 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  37.82 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  37.45 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  37.09 
 
 
269 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  37.82 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  37.45 
 
 
269 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  37.45 
 
 
269 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  37 
 
 
267 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  38.18 
 
 
283 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  41.7 
 
 
258 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  39.39 
 
 
266 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  39.39 
 
 
266 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  39.69 
 
 
267 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  38.26 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  39.58 
 
 
267 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  40.47 
 
 
275 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  40.08 
 
 
276 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  40.08 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  40.08 
 
 
276 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  39.69 
 
 
276 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  39.69 
 
 
276 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36 
 
 
270 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  38.89 
 
 
303 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  39.36 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  37.32 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  37 
 
 
270 aa  172  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  33.95 
 
 
276 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  36.2 
 
 
288 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  35.74 
 
 
277 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  37.13 
 
 
292 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  39.5 
 
 
276 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  38.02 
 
 
281 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  39.91 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  34.18 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  34.18 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  36.68 
 
 
264 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  36.7 
 
 
268 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  35.48 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  40.61 
 
 
264 aa  165  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  36.68 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  36.59 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  37.86 
 
 
360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  37.04 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  36.74 
 
 
285 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  37.21 
 
 
265 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  38.59 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  35.94 
 
 
277 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  36.2 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  37.72 
 
 
312 aa  161  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  36.2 
 
 
279 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  36.43 
 
 
282 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  36.47 
 
 
276 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  37.13 
 
 
272 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  37.17 
 
 
270 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  33.82 
 
 
266 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  32.86 
 
 
307 aa  158  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  35.85 
 
 
278 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  35.56 
 
 
271 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  36.26 
 
 
310 aa  156  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  36.92 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  36.63 
 
 
301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  32.84 
 
 
267 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  34.98 
 
 
275 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  34.98 
 
 
275 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  35.52 
 
 
282 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  36.98 
 
 
278 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  37.22 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  34.18 
 
 
264 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  34.85 
 
 
295 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  35.97 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  36.59 
 
 
268 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  40.48 
 
 
272 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  38.07 
 
 
276 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  37.13 
 
 
267 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  32.32 
 
 
281 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  36.82 
 
 
259 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  36.82 
 
 
259 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  36.06 
 
 
278 aa  148  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  39.35 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  36.95 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  33.21 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  34.48 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  35.58 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  35.58 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  32.13 
 
 
293 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  35.93 
 
 
274 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  33.46 
 
 
278 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  38.1 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  44.1 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  38.28 
 
 
289 aa  145  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>