More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1752 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  100 
 
 		 276 aa  530  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  50 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  40.31 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  46.54 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  45.63 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  40.59 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  45.42 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  44.19 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  45.1 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  43.63 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  43.82 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  44.79 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  40 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  45.8 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  38.4 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  42.86 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  43.97 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  45.06 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  43.28 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  43.63 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  43.13 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  47.24 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  41.51 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  43.85 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  46.51 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  41.98 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  43.18 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  42.75 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  37.26 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  43.21 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  37.31 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  43.46 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  36.5 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  44.36 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  43.85 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  40.56 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  39.53 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  42.75 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  36.03 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  42.5 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  36.88 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  49.32 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  40.23 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  42.59 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  44.81 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  41.58 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  43.65 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  42.41 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  43.94 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  40.45 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  46.18 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  43.85 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  37.79 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36.23 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  37.16 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  35.41 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  46.7 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  48.09 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  43.4 
 
 		 280 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  43.4 
 
 		 280 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  45.42 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  45.42 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  42.86 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  37.13 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  44.36 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  36.78 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  34.38 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  36.22 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  37.3 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  40.3 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  40.3 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  41.08 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  41.46 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  41.08 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  38 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  43.02 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  41.08 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  39.92 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  42.01 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  39.58 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  35.96 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  36.54 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  42.53 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  40.39 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  38.77 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  41.5 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  40 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  35.09 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  43.88 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  38.43 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  38.02 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  41.63 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>