More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0487 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  79.93 
 
 		 272 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  79.93 
 
 		 276 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  77.49 
 
 		 272 aa  447  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  78.87 
 
 		 278 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  79.62 
 
 		 278 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  73.78 
 
 		 275 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  61.22 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  51.91 
 
 		 265 aa  279  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  56.57 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  56.57 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  49.43 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  56.57 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  50.19 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  49.81 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  49.61 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  49.81 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  49.81 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  51.6 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  51.14 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  49.22 
 
 		 273 aa  251  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  50 
 
 		 282 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  47.17 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  47.17 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  47.17 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  47.17 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  47.17 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  48.46 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  47.17 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  47.17 
 
 		 267 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  46.79 
 
 		 269 aa  248  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  46.79 
 
 		 269 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  49.22 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  46.48 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  50 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  47.24 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  51.39 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  47.53 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  46.42 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  49.61 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  54.33 
 
 		 259 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  46.85 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  47.27 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  46.8 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  45.42 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  48.86 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  46.95 
 
 		 258 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  45.32 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  44.09 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  46.18 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  41.76 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  43.45 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  44.37 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  45.02 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  45.42 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  42.57 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  46.88 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  47.83 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  44.07 
 
 		 295 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  41.41 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  44.49 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  45.53 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  47.49 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  44.53 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  44.53 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  46.04 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  42.91 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  47.64 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  46.09 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  47.06 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  46.83 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  43.43 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  41.55 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  43.07 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  47.96 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  46.41 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  44.81 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  40.4 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  46.27 
 
 		 270 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  40.6 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  46.92 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  44.06 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  44.66 
 
 		 275 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  44.06 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  44.06 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  44.06 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  47.55 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  44.65 
 
 		 278 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  41.28 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  40.38 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  45.28 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  40.55 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  43.8 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  45.08 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  45.08 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  39.04 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  43.08 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  44.79 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  43.45 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  42.23 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>