More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0264 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  57.61 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  55.91 
 
 		 282 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  53 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  56.6 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  47.58 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  47.58 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  52.36 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  52.36 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  45.66 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  50.79 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  52.76 
 
 		 278 aa  251  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  50 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  53.49 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  50 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  48.31 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  49.61 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  47.23 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  45.28 
 
 		 268 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  45.52 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  46.69 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  43.33 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  50.56 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  50.56 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  44.4 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  44.28 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  45.42 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  45.42 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  46.89 
 
 		 279 aa  225  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  46.89 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  41.76 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.54 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  50 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  43.85 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  42.54 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  46.69 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  42.54 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  42.91 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  40.53 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  41.64 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  41.48 
 
 		 269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  40.98 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  49.44 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  44.79 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  40.61 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  40.61 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  40.46 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  40.46 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  40.46 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  40.46 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  40.46 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  40.46 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  40.7 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  40.38 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  44.74 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  40.08 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  47.65 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  40.3 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  46.36 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  39.7 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  41.06 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  40.51 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  41.46 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  45.74 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  41.09 
 
 		 284 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  39.54 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  38.11 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  43.58 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  38.79 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  43.18 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  43.61 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  40.38 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  43.51 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  43.02 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  36.72 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  38.22 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  40.16 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  43.75 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  42.01 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  43.23 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  38.43 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  36.82 
 
 		 271 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  38.27 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  39.68 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  38.27 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  40.07 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  37.87 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  40.45 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  43.08 
 
 		 270 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  43.08 
 
 		 360 aa  178  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  43.43 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  43.46 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  42.15 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  45.31 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  37.23 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  40.45 
 
 		 277 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  42.15 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  42.97 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.16 
 
 		 276 aa  174  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  37.6 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>