More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1732 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  100 
 
 
276 aa  553  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  82.2 
 
 
277 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  68.97 
 
 
270 aa  342  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  69.44 
 
 
263 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  67.32 
 
 
282 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  68.25 
 
 
282 aa  329  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  66.54 
 
 
295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  65.5 
 
 
360 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  62.92 
 
 
310 aa  320  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  66.67 
 
 
312 aa  316  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  64.18 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  60.9 
 
 
270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  60.67 
 
 
268 aa  309  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  66.42 
 
 
285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  63.49 
 
 
264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  59.48 
 
 
277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  65.66 
 
 
268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  63.74 
 
 
276 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  61.22 
 
 
293 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  62.69 
 
 
300 aa  299  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  60.47 
 
 
271 aa  291  9e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  62.06 
 
 
292 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  60.77 
 
 
280 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  60.77 
 
 
280 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  62.03 
 
 
268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  60.38 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  56.68 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  59.46 
 
 
278 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  59.46 
 
 
281 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  59.92 
 
 
265 aa  275  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1969  glutamate racemase  55.6 
 
 
254 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  45.53 
 
 
269 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  45.53 
 
 
267 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  45.53 
 
 
267 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  44.75 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  43.24 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  44.79 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  48.4 
 
 
272 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  40.81 
 
 
276 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  45.29 
 
 
303 aa  205  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  41.96 
 
 
276 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  45.28 
 
 
288 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  41.96 
 
 
276 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  41.96 
 
 
276 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  41.57 
 
 
275 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.19 
 
 
270 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  41.57 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  42.97 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  45.77 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  46.36 
 
 
281 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  42.86 
 
 
265 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  40.91 
 
 
307 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  38.82 
 
 
267 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  45.45 
 
 
266 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  40.08 
 
 
271 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  44.14 
 
 
272 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  42.28 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  42.21 
 
 
266 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  44.49 
 
 
275 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  42.21 
 
 
266 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  43.18 
 
 
276 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  37.89 
 
 
280 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  39.76 
 
 
271 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  44.4 
 
 
281 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  41.96 
 
 
267 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  37.89 
 
 
280 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  41.96 
 
 
278 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  40.7 
 
 
258 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  43.63 
 
 
276 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  37.98 
 
 
264 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  38.69 
 
 
291 aa  185  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  43.49 
 
 
283 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  43.14 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  44.79 
 
 
285 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  44.98 
 
 
272 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.84 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  39.31 
 
 
292 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  41.37 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  39.19 
 
 
282 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  40.15 
 
 
263 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.71 
 
 
276 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  40.32 
 
 
261 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  38.83 
 
 
280 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  36.03 
 
 
295 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  37.5 
 
 
264 aa  175  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  38.67 
 
 
289 aa  175  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  40.15 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  40.15 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  38.17 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  39.85 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  40.96 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  43.63 
 
 
259 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  44.19 
 
 
268 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>