More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1783 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  100 
 
 
280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  99.64 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  47.58 
 
 
276 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  51.88 
 
 
279 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  51.5 
 
 
279 aa  251  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  48.03 
 
 
272 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  43.94 
 
 
272 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  48.43 
 
 
278 aa  248  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  47.24 
 
 
288 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  46.06 
 
 
276 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  49.61 
 
 
278 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  46.89 
 
 
282 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  45.22 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  48.03 
 
 
266 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  45.83 
 
 
268 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  44.44 
 
 
272 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  45.85 
 
 
308 aa  234  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  44.53 
 
 
285 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  43.3 
 
 
267 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  42.75 
 
 
272 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  43.85 
 
 
259 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  43.85 
 
 
259 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  42.32 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  42.69 
 
 
259 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.53 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  42.17 
 
 
270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  41.35 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  40.85 
 
 
311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  41.2 
 
 
269 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  41.96 
 
 
275 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  41.96 
 
 
275 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  40.48 
 
 
271 aa  205  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  44.14 
 
 
259 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  41.73 
 
 
270 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  41.7 
 
 
263 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  40.43 
 
 
303 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  39.93 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  39.93 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  39.93 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  39.93 
 
 
269 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  42.86 
 
 
281 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  39.56 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  40.16 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  39.56 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  39.56 
 
 
269 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  39.25 
 
 
267 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  40.87 
 
 
272 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  39.56 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  41.73 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  39.56 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  39.23 
 
 
267 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  39.62 
 
 
267 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  40.3 
 
 
268 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  39.22 
 
 
258 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  40 
 
 
260 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  39.38 
 
 
264 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  39.3 
 
 
291 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  37.7 
 
 
282 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  39.92 
 
 
295 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  39.61 
 
 
274 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  38.43 
 
 
277 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  38.58 
 
 
266 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  38.58 
 
 
266 aa  189  4e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  38.43 
 
 
273 aa  188  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  37.89 
 
 
276 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  38.58 
 
 
267 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  36.92 
 
 
268 aa  185  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  38.89 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  36.58 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  37.07 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  36.8 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  34.07 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  36.63 
 
 
312 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  36.98 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  37.8 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  37.36 
 
 
276 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  37.18 
 
 
284 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  36.12 
 
 
261 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  38.19 
 
 
269 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  37.45 
 
 
264 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  35.88 
 
 
285 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  37.4 
 
 
271 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  38.58 
 
 
276 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  36.05 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  36.05 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  38.13 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  39.69 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  38.46 
 
 
271 aa  178  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  36.58 
 
 
301 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  37.27 
 
 
291 aa  178  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  37 
 
 
360 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  32.96 
 
 
264 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  38.22 
 
 
265 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  34.62 
 
 
265 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  35.66 
 
 
280 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  37.5 
 
 
293 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  35.53 
 
 
307 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  31.84 
 
 
271 aa  175  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  37.89 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  36.6 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>