More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0104 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  100 
 
 		 264 aa  540  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  67.43 
 
 		 256 aa  364  1e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  45.63 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  44.87 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  44.39 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  43.13 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  43.12 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  38.72 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  40.08 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  42 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  42.24 
 
 		 280 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  39.76 
 
 		 271 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  41.45 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  40.53 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  40.91 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  40.87 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  40.15 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  39.45 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  42.98 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  40.64 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  42.17 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  39.76 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  35.23 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  40.39 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  37.4 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  41.08 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  36.12 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  34.48 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  33.98 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  36.11 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  36.32 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  37.82 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  36.54 
 
 		 270 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  34.8 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  34.36 
 
 		 268 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  34.36 
 
 		 263 aa  148  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  40 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  36.9 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  36.71 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  37.07 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  32.38 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  32.08 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  37.71 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  31.95 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  33.72 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  37.02 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  37.02 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  36.27 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  36.55 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  34.22 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  36.05 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  35.34 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2842  glutamate racemase  39.19 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.446044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2463  glutamate racemase  39.19 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.794821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  29.73 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  31.4 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  30.3 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  36.6 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  36.6 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  36.6 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  36.6 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  34.41 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  32.06 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  32.77 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  32.77 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  34.84 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  30.57 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  31.63 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  28.79 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  35.47 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  32.14 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  34.59 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  35.78 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  34.04 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  35.15 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  32.32 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  36.17 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  28.52 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  37.89 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  27.73 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  36.17 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  40.25 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  35.04 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  38.19 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  32.45 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  35.9 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  34.65 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  36.8 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  30.93 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  33.09 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  33.73 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  35.56 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  29.44 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  30.08 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  30.62 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0284  glutamate racemase  38.05 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  32.05 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  30.08 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  34.55 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  34.06 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>