More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0590 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  52.45 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  51.72 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  44.02 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  41.43 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  39.62 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  41.59 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  40.65 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  36.12 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  35.19 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2463  glutamate racemase  35.78 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.794821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2842  glutamate racemase  35.78 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.446044  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  34.07 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  31.73 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  35.65 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  31.2 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  31.07 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  30.65 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  30.36 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  35.78 
 
 		 266 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2156  glutamate racemase  36.55 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185114  normal  0.250573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  34.03 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  36.04 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  30.52 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  30.24 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  33.94 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  29.44 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  30.92 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  35.98 
 
 		 333 aa  125  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  26.29 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  30.31 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  35.16 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  34.11 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  30 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  35.98 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  29.44 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  35.15 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  29.62 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  28.97 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  27.83 
 
 		 295 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  29.58 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  29.62 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  33.48 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  36.76 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  30.43 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  35.55 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  29.44 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  32.86 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  34.74 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  31.34 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  28.92 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  32.51 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  31.07 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  34.74 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  28.74 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  31.96 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  30.81 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  30.22 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  31.28 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  29 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  34.17 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  30.36 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  27.5 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  30.31 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  34.02 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0629  glutamate racemase  32.63 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  31.92 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  34.5 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2884  glutamate racemase  34.42 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00254237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  30.61 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  32.04 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  29.44 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1554  glutamate racemase  32.17 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  29.82 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  29.81 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  33.5 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2339  glutamate racemase  28.79 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  30.49 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  28.11 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  26.19 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  29.61 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  27.31 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  26.83 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  31.25 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0194  glutamate racemase  29.8 
 
 		 266 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000010481  normal  0.0134241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0284  glutamate racemase  34.74 
 
 		 340 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  29.3 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  28.84 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1824  glutamate racemase  30.91 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  25.24 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  25.24 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0232  glutamate racemase  31.43 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000508837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  30.08 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0133  glutamate racemase  30.95 
 
 		 290 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00475482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  25.24 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  25.24 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  25.24 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  25.24 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  31.8 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1643  glutamate racemase  30.91 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>