More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2156 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2156  glutamate racemase  100 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185114  normal  0.250573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  37.65 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  36.86 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  38.18 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  37.79 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  39.35 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  35.32 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  36.97 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  37.79 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  38.32 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  38.43 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  38.43 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  35.81 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  34.38 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  35.81 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  37.56 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  35.35 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  37.84 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  32.57 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  35.81 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  30.8 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000377093  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  35.32 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  36.28 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  37.85 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  33.47 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  37.67 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  37.38 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0180  glutamate racemase  31.06 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.815538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  36.87 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  34.47 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  36.11 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  37.67 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  30.65 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0174  glutamate racemase  30.42 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000222817  normal  0.0305567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  35.65 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  34.88 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.65 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  38.6 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  35.94 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  36.36 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  32.09 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  37.61 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0177  glutamate racemase  32.42 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000496539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0181  glutamate racemase  32.42 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000024601  hitchhiker  0.0092557 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  36.74 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  36.74 
 
 		 285 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  36.55 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  37.77 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4075  glutamate racemase  32.42 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000696712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  36.2 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  36.74 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  36.06 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4177  glutamate racemase  31.96 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000486061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  38.91 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  36.09 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  34.72 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  37.5 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  33.95 
 
 		 290 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  33.95 
 
 		 290 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  35.44 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  36.41 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  33.95 
 
 		 290 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  36.68 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  31.06 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  35.75 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  31.63 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  34.21 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02590  glutamate racemase  32.18 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  31.7 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  33.49 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  33.49 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  33.49 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  38.12 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  31.73 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  33.49 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0126  glutamate racemase  32.74 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000153552  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  32.41 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  32.74 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  35.6 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1245  glutamate racemase  37.61 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2339  glutamate racemase  33.82 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  30.56 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00256  glutamate racemase  31.09 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0232  glutamate racemase  32.22 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000508837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0139  glutamate racemase  30.63 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000684264  normal  0.0718658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0629  glutamate racemase  33.19 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3509  glutamate racemase  30.04 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00151792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  34.21 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  31.58 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  30.23 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3000  glutamate racemase  37.14 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  33.18 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4337  glutamate racemase  32.08 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000357145  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002158  glutamate racemase  34.8 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000004702  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  29.06 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  30.14 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  32.2 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  32.06 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  29.3 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  32.06 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>