More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4453 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  100 
 
 		 265 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  85.66 
 
 		 265 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  86.42 
 
 		 265 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  84.53 
 
 		 265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  73.28 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  73.46 
 
 		 275 aa  387  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  73.08 
 
 		 271 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  71.04 
 
 		 263 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  70.5 
 
 		 263 aa  359  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  68.3 
 
 		 265 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  69.2 
 
 		 265 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  57.63 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  49.6 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  52.55 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  43.73 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  51.54 
 
 		 277 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  48.48 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  50.77 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  48.28 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  49.8 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  49.81 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  49.81 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  49.81 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  47.71 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  49.23 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  49.43 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  49.43 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  49.03 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  49.43 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  49.43 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  47.51 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  46.95 
 
 		 288 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  49 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  47.83 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  42.34 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  42.28 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  53.17 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  48.29 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  41.87 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  47.74 
 
 		 287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  46.75 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  47.53 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  43.5 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  47.53 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  47.53 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  46.22 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  39.16 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  46.76 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  44.9 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  42.5 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  45.7 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  44.86 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  47.71 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  40.73 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  44.96 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  43.25 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  48.23 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  43.12 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  44.26 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  45.49 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  45.21 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  41.39 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  46.29 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  45.76 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  43.72 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0104  glutamate racemase  42 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  43.44 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  45.58 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  41.94 
 
 		 271 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  42.34 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  40.72 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  39.5 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  39.37 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  40.16 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  41.43 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36.58 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  40.08 
 
 		 266 aa  168  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  38.6 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  40.25 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  36.63 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1073  glutamate racemase  45.09 
 
 		 277 aa  165  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  37.93 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  33.87 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  40.89 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  36.86 
 
 		 278 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  40.72 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  39.06 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0440  glutamate racemase  37.34 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000912391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  39.06 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09920  glutamate racemase  37.1 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634287  normal  0.13498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  38.31 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  31.47 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  33.74 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  41.05 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  35.59 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  36 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  36 
 
 		 282 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  32.2 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  39.11 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  37.4 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>