More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1554 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1554  glutamate racemase  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221253  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1824  glutamate racemase  55.47 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1643  glutamate racemase  55.06 
 
 		 247 aa  296  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2013  glutamate racemase  54.66 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  55.28 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  44.91 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  37.7 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  37.7 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  39.37 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  43.32 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  33.72 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  36.14 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  34.4 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  34.8 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  34.4 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  33.99 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  33.73 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  33.73 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  33.47 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  36.41 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  38.07 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  34 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  37.5 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  33.2 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  36.74 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  34.4 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  35.06 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  38.02 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  34.66 
 
 		 264 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  34.39 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  32.81 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36.65 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  37.16 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  33.07 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  32.42 
 
 		 272 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  34.92 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  32.42 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  36 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  32.02 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  36.51 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  34.35 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  35.6 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  34.36 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  32.4 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  36.36 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  34.52 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  29.69 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  37.32 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  31.75 
 
 		 268 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  30.86 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  30.68 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  34.03 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  34.12 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  34.84 
 
 		 272 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  34.13 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  29.25 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  34.13 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  31.08 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  37.1 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  30.04 
 
 		 282 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  32.81 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  30.95 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  34.13 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  31.2 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  33.6 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  29.41 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  30.43 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0872  glutamate racemase  30.28 
 
 		 300 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  33.46 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  34.29 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  31.6 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  31.6 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  39.52 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  29.33 
 
 		 270 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0153  glutamate racemase  30.08 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000323357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  31.2 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  36.27 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  32.05 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  29.08 
 
 		 301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  31.5 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  34.13 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  34.91 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  30.59 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  34.91 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0061  glutamate racemase  37.12 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.21676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  29.37 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  30.92 
 
 		 281 aa  125  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  31.53 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  31.35 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  30.43 
 
 		 284 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  29.88 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  30.16 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  29.6 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>