More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0473 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0473  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  47.27 
 
 
269 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  45.35 
 
 
269 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  34.35 
 
 
265 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  37.4 
 
 
276 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  34.51 
 
 
281 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  33.71 
 
 
268 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  34.1 
 
 
275 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  34.1 
 
 
275 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  36.26 
 
 
277 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  37.01 
 
 
277 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  33.33 
 
 
271 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  37.45 
 
 
272 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  35.14 
 
 
267 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  34.11 
 
 
264 aa  148  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  32.82 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  32.68 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  36.12 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  33.33 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0885  glutamate racemase  36.33 
 
 
268 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  34.21 
 
 
312 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2737  glutamate racemase  33.96 
 
 
292 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  38.76 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  36.6 
 
 
268 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36.05 
 
 
270 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  31.68 
 
 
271 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  32.57 
 
 
274 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  33.98 
 
 
261 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  34.65 
 
 
272 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  33.33 
 
 
310 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  32.82 
 
 
272 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  33.6 
 
 
289 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  33.83 
 
 
268 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  33.87 
 
 
269 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  35.89 
 
 
272 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  31.66 
 
 
267 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  32.18 
 
 
269 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  33.72 
 
 
280 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  31.95 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  36.55 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  38.05 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  32.81 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  32.06 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  32.06 
 
 
288 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  33.58 
 
 
263 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  32.34 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  32.95 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  33.72 
 
 
268 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  33.61 
 
 
266 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  33.61 
 
 
266 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  32.28 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  39.13 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  29.92 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  31.94 
 
 
280 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  31.64 
 
 
277 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  30.32 
 
 
307 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  32.82 
 
 
276 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  31.94 
 
 
280 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  36.53 
 
 
278 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  32.77 
 
 
272 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  33.71 
 
 
285 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  32.58 
 
 
270 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  33.76 
 
 
260 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  34.26 
 
 
291 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  31.56 
 
 
264 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  41.97 
 
 
259 aa  135  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  31.92 
 
 
301 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  32.45 
 
 
280 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  33.08 
 
 
280 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  34.02 
 
 
267 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  33.08 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  29.5 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  33.08 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  33.84 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  33.46 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  31.56 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  31.47 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  30.68 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  33.99 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  31.32 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  32.56 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  33.63 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  31.08 
 
 
278 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  32.02 
 
 
271 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  31.42 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  35.02 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  132  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  31.42 
 
 
269 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  33.2 
 
 
281 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  32.3 
 
 
270 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  31.42 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  30.28 
 
 
283 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  31.03 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  31.11 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>