More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6812 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  100 
 
 		 268 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  58.49 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  58.49 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  56.98 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  49.1 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  50.59 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  55.47 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  55.45 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  49.61 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  47.84 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  42.97 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  49.02 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  49.8 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  50.2 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  47.04 
 
 		 265 aa  221  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  49.62 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  47.35 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  47.35 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  44.36 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  46.35 
 
 		 272 aa  214  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  47.27 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  43.18 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  45.59 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  45.21 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  46.64 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  45.5 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  55.61 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  45.32 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  41.15 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  45.58 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  46.52 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.25 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  37.88 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  45.66 
 
 		 280 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  44.26 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  48.75 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  41.69 
 
 		 291 aa  191  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  44.57 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  45.21 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  44.19 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  50 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  47.11 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  40.23 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  45.09 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  35.11 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  36.09 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  35.34 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  35.34 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  35.34 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  35.34 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  36.15 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  36.15 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  35.34 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  34.96 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  35.34 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  46.75 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  35.34 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  42.04 
 
 		 311 aa  175  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  44.5 
 
 		 267 aa  175  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  39.17 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  39.9 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  42.75 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  42.75 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  35.91 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  45.07 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  45.45 
 
 		 284 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  37.02 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  43.45 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  37.5 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  36.86 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  38.49 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  40.81 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  35.91 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  42.49 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  38.67 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  42.63 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  42.63 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  35.29 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  40.54 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  43.37 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  40.72 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  46.12 
 
 		 281 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  36.86 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  42.86 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  42.57 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  35.14 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  43.93 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  43.22 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  41.18 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  43.22 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  39.11 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  36.47 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  44.95 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  35.88 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1554  glutamate racemase  36.67 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  40.82 
 
 		 276 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  48.23 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  38.82 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  34.98 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>