More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3114 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  49.81 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  50.64 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  46.74 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  49.79 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  45.16 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  50.22 
 
 		 276 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  50.23 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  52.23 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  47.76 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  50.67 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  48.43 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  46.69 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  45.74 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  50.47 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  45.53 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  39.3 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  45.97 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  47.77 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  49.54 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  46.19 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  50.47 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  47.39 
 
 		 265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  50.47 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  50 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  45.74 
 
 		 270 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  45.53 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  48.4 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  50 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  50 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  50 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  50 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  49.32 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  47.2 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  50.47 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  46.26 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  47.2 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  50 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  50 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  50 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  50 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  44.71 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  41.78 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  49.43 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  45.66 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  51.14 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  46.91 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  43.4 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  41.82 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  35.16 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  44.64 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  35.55 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  38.84 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  38.84 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  42.8 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  45.41 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  41.45 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  39.84 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  40.3 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  35.8 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  39.85 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  36.49 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  40.77 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.61 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  43.28 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  38.89 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  33.47 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  40.44 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  42.62 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  36.89 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  36 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  37.08 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5648  glutamate racemase  37.55 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  39.73 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2315  glutamate racemase  38.6 
 
 		 360 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000133426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  41.55 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  38.31 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  34.1 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  38.53 
 
 		 276 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  39.91 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  38.74 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  37.95 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  39.47 
 
 		 301 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  39 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  37.93 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  38.08 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  38.08 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  34.82 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  33.19 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  34.36 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  35.47 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  36.53 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  39.22 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4289  glutamate racemase  38.31 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  35.36 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  37.28 
 
 		 312 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25070  glutamate racemase  39.04 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  37.34 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  33.08 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  37.61 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>