More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0617 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  847    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  72.53 
 
 		 418 aa  609  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  71.08 
 
 		 416 aa  595  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  67.25 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 		 411 aa  555  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 		 410 aa  546  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0778  serine hydroxymethyltransferase  60.74 
 
 		 414 aa  521  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 414 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 414 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 413 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 413 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 414 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 		 412 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 		 412 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.21 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  64.21 
 
 		 422 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 422 aa  497  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  58.03 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  57.79 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 427 aa  491  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 		 413 aa  490  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 418 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  58.95 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  57.88 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 418 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.1 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 418 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  58.95 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 410 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>