More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0778 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0778  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 414 aa  855    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  66.92 
 
 		 410 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 411 aa  522  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  60.74 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 416 aa  514  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.67 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.57 
 
 		 416 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  57.43 
 
 		 415 aa  484  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 412 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 412 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 410 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.53 
 
 		 418 aa  477  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  56.44 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.57 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  57.67 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  57.57 
 
 		 410 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  56.68 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  55.91 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  56.58 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 412 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  56.79 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  56.82 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  56.08 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.91 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 414 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.08 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  55.33 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 412 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 424 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 410 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 412 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55.67 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  54.19 
 
 		 411 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  55.67 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  56.82 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  55.22 
 
 		 454 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  55.33 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  53.47 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  56.44 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.09 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  55.33 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  54.3 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  55.86 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  53.9 
 
 		 422 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  54.95 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 419 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  53.81 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  54.32 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 418 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  53.3 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 422 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>