More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0796 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  79.81 
 
 		 418 aa  682    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 416 aa  853    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  71.08 
 
 		 415 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  62.69 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 411 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0778  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  62.91 
 
 		 411 aa  521  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  62.16 
 
 		 417 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 		 418 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 414 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 414 aa  512  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 438 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 414 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 432 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  59.29 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 415 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 438 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  62.16 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.48 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  57.79 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 433 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 418 aa  494  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  58.75 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>