More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1074 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 418 aa  863    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  79.81 
 
 		 416 aa  682    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  72.53 
 
 		 415 aa  619  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  64.44 
 
 		 411 aa  541  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  63.05 
 
 		 411 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  62.03 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 411 aa  511  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.92 
 
 		 412 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0778  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 439 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.96 
 
 		 433 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 422 aa  501  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  59.09 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60.59 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  58.61 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 422 aa  491  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.95 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  57.72 
 
 		 432 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  58.03 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 413 aa  488  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  58.03 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  57.89 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  56.53 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.86 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 414 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  57.89 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 		 421 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  55.98 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  57.72 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 427 aa  481  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  56.79 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  55.92 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 427 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>