More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0422 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0422  transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00307328  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1184  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 272 aa  208  6e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2058  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0850  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.171702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  26.29 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  26.88 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  24.63 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2508  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000736174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8674  transcriptional regulator, LysR family  26.13 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  24.21 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  24.21 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  26.27 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  23.11 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  23.81 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1195  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279757  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  23.81 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  31.06 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.07 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  25.66 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  25.49 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  26.41 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  25.97 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3781  LysR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.852232  normal  0.126897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25.82 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.19 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.19 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.19 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  22.53 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1047  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6511  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  21.81 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1889  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  26.41 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2862  hypothetical protein  26.67 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  22.27 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1575  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.684291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  23.17 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  25.41 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1584  transcriptional regulator, LysR family protein  22.98 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0327  LysR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  23.19 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1974  LysR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168317  normal  0.460832 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2197  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>