More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2058 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2058  transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  566  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1184  transcriptional regulator  48.52 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0850  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.171702  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0422  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00307328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  29.22 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.51 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  28.94 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  28.01 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  28.94 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  28.94 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  25.94 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 297 aa  99  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 298 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3312  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.27 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.404557 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  27.39 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0951  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 320 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  25.36 
 
 		 320 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1478  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.81 
 
 		 347 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4612  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.681307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.42 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.6 
 
 		 290 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 328 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  24.82 
 
 		 319 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  25.68 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.26 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2193  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.35809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  22.88 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0345  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 325 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 309 aa  85.5  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3540  transcriptional regulator, LysR family  24.54 
 
 		 317 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 304 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0110  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  25.62 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  27.95 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.48 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  25 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  25.08 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3225  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.3 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>