More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1184 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1184  transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2058  transcriptional regulator  48.52 
 
 		 275 aa  281  9e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0850  transcriptional regulator  41.5 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.171702  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0422  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00307328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 301 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  28.26 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  28.26 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3312  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.68 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.404557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4612  transcriptional regulator, LysR family  28.89 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.681307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1478  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.89 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  27.35 
 
 		 308 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  27.35 
 
 		 308 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 314 aa  98.6  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.55 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  29.52 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  29.22 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  29.22 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 313 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 313 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3540  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 325 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 311 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 314 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5196  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  27.02 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  30.25 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1882  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 302 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0108244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  26.1 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 320 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  25.31 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 310 aa  89  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  24.69 
 
 		 316 aa  88.6  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  25.31 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  23.4 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  23.4 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4857  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2818  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246785  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2307  transcriptional regulator, LysR family  26.1 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.870686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  23.24 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1347  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.98443  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4974  transcriptional regulator, LysR family  24.72 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  25.62 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>