100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14290 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  100 
 
 		 481 aa  947    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  37.47 
 
 		 474 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  39.2 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  39.11 
 
 		 547 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  40.61 
 
 		 424 aa  224  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  37.87 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  37.87 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  35.59 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  37.4 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  38.66 
 
 		 377 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  37.63 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  38.66 
 
 		 377 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  37.4 
 
 		 423 aa  210  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  36.34 
 
 		 405 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  38.66 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  35.34 
 
 		 405 aa  209  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  36.29 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  36.8 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  34.68 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  34.43 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  34.43 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  36.09 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  34.79 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  34.17 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  33.5 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  33.89 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  36.03 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  31.02 
 
 		 410 aa  176  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  33.42 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  32.2 
 
 		 466 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  34.37 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  33.18 
 
 		 594 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  38.58 
 
 		 256 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  36.6 
 
 		 268 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  26.21 
 
 		 545 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  28.35 
 
 		 541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  28.85 
 
 		 589 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  28.81 
 
 		 494 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  29.59 
 
 		 567 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  28.48 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  30.71 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.17 
 
 		 603 aa  93.6  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.2 
 
 		 556 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  28.02 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  27.09 
 
 		 568 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.88 
 
 		 507 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.22 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  27.52 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  30.79 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.23 
 
 		 580 aa  83.2  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  30.23 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  28.46 
 
 		 535 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.6 
 
 		 585 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.66 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  26.88 
 
 		 551 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  27.44 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.55 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  25.12 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.41 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.99 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  28.61 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.56 
 
 		 714 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  35.77 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  26.44 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  25.88 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  36.84 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  27.42 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  34.19 
 
 		 580 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 584 aa  53.9  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  38.55 
 
 		 442 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  32.76 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  36.44 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  32.76 
 
 		 577 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  36 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 546 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  33.08 
 
 		 628 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 561 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  28.63 
 
 		 469 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 748 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  34.68 
 
 		 620 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  36.04 
 
 		 637 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  48.48 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  34.15 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  25.68 
 
 		 498 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  36.11 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 627 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 360 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  31.25 
 
 		 539 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  34.29 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  28.43 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  31.67 
 
 		 661 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 418 aa  43.9  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  27.42 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.04 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  27.42 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1015  HNH endonuclease  43.24 
 
 		 191 aa  43.5  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>