115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3968 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  100 
 
 		 457 aa  914    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  69.43 
 
 		 479 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  61.66 
 
 		 547 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  60.7 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  55.87 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  55.87 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  54.3 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  55.91 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  55.45 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  54.91 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  54.91 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  50.13 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  48.77 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  48.77 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  49.23 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  51.54 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  48.96 
 
 		 436 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  49.74 
 
 		 430 aa  319  5e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  48.63 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  48.07 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  48.99 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  44.74 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  45.05 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  39.2 
 
 		 481 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  39.54 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  39.9 
 
 		 405 aa  246  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  39.6 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  38.52 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  38.62 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  39.44 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  39.18 
 
 		 408 aa  224  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  48.04 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  51.06 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  36.25 
 
 		 555 aa  194  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  45.91 
 
 		 256 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  33.81 
 
 		 594 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  32.93 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  32.93 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.49 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  32.3 
 
 		 541 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  30.97 
 
 		 567 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.76 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.33 
 
 		 507 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.26 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.11 
 
 		 580 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  30.79 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.17 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.5 
 
 		 508 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.13 
 
 		 556 aa  86.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.16 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.34 
 
 		 620 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  26.1 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.69 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  30.3 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.51 
 
 		 516 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.21 
 
 		 530 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  26.8 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.97 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.87 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  23.24 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.62 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  29.59 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.76 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.38 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.38 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.12 
 
 		 748 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  33.59 
 
 		 628 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  27.89 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  29.01 
 
 		 714 aa  60.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  28.37 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  26.19 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  27.16 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.14 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.97 
 
 		 484 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  26.05 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  40.17 
 
 		 620 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  28.98 
 
 		 519 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 603 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  36.67 
 
 		 546 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 637 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  30 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  38.04 
 
 		 635 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  32.56 
 
 		 553 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  28.1 
 
 		 222 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  29.76 
 
 		 539 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  38.1 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  38.03 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  29.35 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  37.23 
 
 		 516 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  28.97 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  33.71 
 
 		 581 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  33.71 
 
 		 581 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  31.17 
 
 		 561 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  37.35 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  33.71 
 
 		 578 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  35.42 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  37.23 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 582 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>