195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4258 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  100 
 
 		 443 aa  881    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  96.39 
 
 		 443 aa  795    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  61.52 
 
 		 567 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  66.84 
 
 		 426 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  58.06 
 
 		 310 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  44.33 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4974  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  32 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  34.01 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.48 
 
 		 580 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  33.97 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  34.82 
 
 		 620 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  29.18 
 
 		 507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  30.38 
 
 		 551 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 516 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  46.53 
 
 		 748 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  29.09 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  29.27 
 
 		 535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  32.25 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  30.17 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  30.7 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  30.75 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  30.75 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  40.59 
 
 		 637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  41.4 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  36.52 
 
 		 585 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  31.18 
 
 		 481 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.88 
 
 		 498 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40.12 
 
 		 628 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  34.02 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  42.52 
 
 		 605 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  40 
 
 		 580 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  30.88 
 
 		 567 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 714 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  30.72 
 
 		 484 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  40.16 
 
 		 558 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  40 
 
 		 584 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  30.03 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.76 
 
 		 511 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  29.21 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  38.82 
 
 		 602 aa  97.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  30.06 
 
 		 502 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  29.94 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  29.71 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  27.22 
 
 		 603 aa  90.9  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  28.96 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  28.96 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  28.96 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  28.86 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  28.86 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  29.39 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  33.45 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  44.68 
 
 		 539 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  44.68 
 
 		 512 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  29.14 
 
 		 475 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  30.49 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  28.75 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  39.23 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  38.33 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  27.96 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  39.04 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  31.95 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  26.24 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  28.41 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  50 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  31.76 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  28.66 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  27.66 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  27.66 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  44.9 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  44.9 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  44.9 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  28.98 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3087  hypothetical protein  28.5 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  48.61 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  45.65 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.56 
 
 		 565 aa  78.2  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  27.65 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  31.03 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  45.26 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  36.81 
 
 		 743 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  28.69 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  45.26 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  39.52 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  29.07 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  45.26 
 
 		 593 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  28.85 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  31.14 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  45.26 
 
 		 593 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  38.71 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.27 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  42.71 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  34.03 
 
 		 709 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  42.11 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  37.9 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  37.9 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  28.65 
 
 		 577 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  35 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>