99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1759 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  100 
 
 
410 aa  826    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  67.1 
 
 
405 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  65.23 
 
 
403 aa  504  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  66.06 
 
 
405 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  65.28 
 
 
404 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  66.16 
 
 
408 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  64.45 
 
 
404 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  46.83 
 
 
430 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  46.83 
 
 
430 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  48.25 
 
 
424 aa  273  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  45.34 
 
 
411 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  46.83 
 
 
377 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  46.83 
 
 
377 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  47.11 
 
 
475 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  46.49 
 
 
436 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  44.17 
 
 
434 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  45.17 
 
 
426 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  43.89 
 
 
434 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  43.89 
 
 
434 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  45.77 
 
 
430 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  43.8 
 
 
430 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  43.01 
 
 
466 aa  252  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  38.69 
 
 
547 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  41.67 
 
 
426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  38.5 
 
 
474 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  41.83 
 
 
457 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  38.48 
 
 
479 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  51.3 
 
 
268 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  39.65 
 
 
441 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  38.55 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  39.16 
 
 
437 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  31.02 
 
 
481 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  39.56 
 
 
340 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  31.69 
 
 
555 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  41.43 
 
 
256 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  30.42 
 
 
594 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  35.34 
 
 
541 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  31.63 
 
 
545 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.02 
 
 
589 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  30.87 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.63 
 
 
580 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.2 
 
 
499 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.88 
 
 
535 aa  83.2  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  29.21 
 
 
480 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  29.21 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  29.21 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  28.88 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.25 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.04 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.06 
 
 
567 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  24.53 
 
 
620 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.34 
 
 
507 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.41 
 
 
566 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.62 
 
 
516 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.93 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.16 
 
 
511 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  32.98 
 
 
310 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  27.3 
 
 
488 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  23 
 
 
585 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.27 
 
 
551 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  35.06 
 
 
714 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  33.09 
 
 
628 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  32.87 
 
 
605 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  30.9 
 
 
580 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  31.54 
 
 
558 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  27.32 
 
 
567 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  31.86 
 
 
443 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.3 
 
 
530 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  27.22 
 
 
443 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  30.87 
 
 
584 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  27.69 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  34.35 
 
 
603 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  26.96 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  41.38 
 
 
517 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  40.23 
 
 
519 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  26.85 
 
 
498 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  24.34 
 
 
464 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  25.6 
 
 
523 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  32.24 
 
 
535 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  32.02 
 
 
524 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29.87 
 
 
602 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  34.17 
 
 
748 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  25.54 
 
 
442 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  25.54 
 
 
442 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  30.73 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  38.2 
 
 
582 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  27.42 
 
 
519 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  38.1 
 
 
519 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.37 
 
 
512 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  37.8 
 
 
539 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  25.95 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  30.21 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  24.67 
 
 
473 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  32.41 
 
 
516 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  23.93 
 
 
566 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  30.49 
 
 
441 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  28.93 
 
 
222 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  27.42 
 
 
360 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>