72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2892 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  90.82 
 
 		 423 aa  370  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  73.95 
 
 		 437 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  49.76 
 
 		 424 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  49.29 
 
 		 475 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  51.64 
 
 		 430 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  51.64 
 
 		 430 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  50 
 
 		 434 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  48.1 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  49.53 
 
 		 434 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  46.09 
 
 		 474 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  49.53 
 
 		 434 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  46.9 
 
 		 426 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  51.76 
 
 		 377 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  51.76 
 
 		 411 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  51.76 
 
 		 377 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  49.32 
 
 		 479 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  51.02 
 
 		 441 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  44.89 
 
 		 404 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  42.86 
 
 		 547 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  44.35 
 
 		 436 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  44.89 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  44.89 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  45.78 
 
 		 408 aa  161  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  44.54 
 
 		 426 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  43.17 
 
 		 430 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  45.33 
 
 		 404 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  38.58 
 
 		 481 aa  151  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  40.61 
 
 		 430 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  44.1 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  41.43 
 
 		 410 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  38.66 
 
 		 466 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  43.26 
 
 		 594 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  34.26 
 
 		 589 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  37.1 
 
 		 555 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  35.78 
 
 		 545 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  35.96 
 
 		 494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  33.85 
 
 		 541 aa  89  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  35.42 
 
 		 340 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  28.28 
 
 		 499 aa  82.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.94 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  32.89 
 
 		 556 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  28.62 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  29.63 
 
 		 551 aa  72  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  30.19 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  29.61 
 
 		 568 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.86 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  29.49 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  29.22 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  32.81 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  28.81 
 
 		 507 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.24 
 
 		 510 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  36.81 
 
 		 530 aa  62  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  35.25 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40 
 
 		 628 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  37.07 
 
 		 603 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  31.97 
 
 		 558 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 580 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  27.35 
 
 		 566 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  32.98 
 
 		 443 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  25.1 
 
 		 585 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  30.05 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  30.33 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 602 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  29.41 
 
 		 553 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  33.59 
 
 		 637 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 714 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  26.52 
 
 		 360 aa  45.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  32.41 
 
 		 748 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  29.93 
 
 		 502 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>