94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3247 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  100 
 
 
547 aa  1087    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  82.3 
 
 
474 aa  717    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  61.21 
 
 
457 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  58.28 
 
 
479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  48.16 
 
 
430 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  48.16 
 
 
430 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  48.26 
 
 
475 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  47.24 
 
 
411 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  47.68 
 
 
377 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  47.68 
 
 
377 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  46.17 
 
 
434 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  46.26 
 
 
424 aa  329  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  45.94 
 
 
434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  45.94 
 
 
434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  45.09 
 
 
430 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  42.86 
 
 
436 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  43.21 
 
 
430 aa  297  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  43.95 
 
 
466 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  42.89 
 
 
426 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  43.97 
 
 
441 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  42.56 
 
 
426 aa  289  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  41.55 
 
 
405 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  42.15 
 
 
423 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  39.26 
 
 
404 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  40.33 
 
 
403 aa  260  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  44.33 
 
 
437 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  39.39 
 
 
410 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  39.35 
 
 
405 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  40.5 
 
 
408 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  38.57 
 
 
404 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  39.11 
 
 
481 aa  229  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  44.36 
 
 
268 aa  199  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  34.06 
 
 
555 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  37.66 
 
 
340 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  43.23 
 
 
256 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  31.4 
 
 
594 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  30.98 
 
 
494 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  32.32 
 
 
589 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  29.86 
 
 
545 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  30.28 
 
 
541 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.47 
 
 
580 aa  84.7  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.25 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  25.17 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  23.42 
 
 
566 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  24.64 
 
 
620 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  25.7 
 
 
508 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  24.5 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.46 
 
 
567 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  25.18 
 
 
585 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  25.32 
 
 
510 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.56 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25.17 
 
 
556 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  27.96 
 
 
507 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  32.87 
 
 
714 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  29.84 
 
 
628 aa  60.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  29.02 
 
 
530 aa  60.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  32.54 
 
 
310 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  27.44 
 
 
580 aa  58.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29 
 
 
602 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  27.83 
 
 
558 aa  57.4  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  28.43 
 
 
584 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  31.9 
 
 
605 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  25.62 
 
 
488 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.62 
 
 
511 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  25.68 
 
 
480 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  42.22 
 
 
546 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  34.62 
 
 
603 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  37.23 
 
 
635 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  33.77 
 
 
561 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  24.86 
 
 
480 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.81 
 
 
484 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  24.86 
 
 
480 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  25.41 
 
 
475 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  36.56 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  33.33 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  39.62 
 
 
473 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.81 
 
 
567 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  34.06 
 
 
443 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  35.51 
 
 
443 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  30.3 
 
 
572 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  38.36 
 
 
432 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  31.06 
 
 
553 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  26.13 
 
 
637 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  37.08 
 
 
535 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  27.66 
 
 
661 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  29.49 
 
 
516 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  38.36 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  36.25 
 
 
620 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  30.7 
 
 
627 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  26.37 
 
 
748 aa  43.9  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  31.71 
 
 
442 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  31.65 
 
 
582 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  36.99 
 
 
417 aa  43.9  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>