87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0309 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  755    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  92.62 
 
 		 430 aa  673    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  99.2 
 
 		 411 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  755    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  92.62 
 
 		 430 aa  673    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  76.31 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  75.55 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  75.55 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  75.55 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  72.83 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  70.42 
 
 		 430 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  69.44 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  69.21 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  68.88 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  68.09 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  65.92 
 
 		 426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  55.4 
 
 		 457 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  47.68 
 
 		 547 aa  349  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  46.93 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  52.66 
 
 		 479 aa  335  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  65.11 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  67.81 
 
 		 268 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  49.58 
 
 		 405 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  50.68 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  47.59 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  46.83 
 
 		 410 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  47.59 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  46.74 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  46.7 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  45.11 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  47.03 
 
 		 408 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  48.16 
 
 		 404 aa  263  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  38.48 
 
 		 481 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  36.74 
 
 		 555 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  51.17 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  34.68 
 
 		 494 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  34.9 
 
 		 545 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  32.63 
 
 		 589 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  34.06 
 
 		 541 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  47.59 
 
 		 594 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  29.59 
 
 		 510 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.53 
 
 		 556 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.98 
 
 		 567 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.46 
 
 		 499 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  25.99 
 
 		 508 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.16 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  24.54 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.01 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  25.06 
 
 		 580 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  23.92 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.83 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.96 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.35 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.78 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.27 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.52 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.02 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  29.63 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  27.73 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  28.45 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  28.45 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  28.45 
 
 		 480 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30.86 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  32.22 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.13 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.49 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  27.83 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28.72 
 
 		 605 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  26.95 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  30.72 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  27.92 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  27.06 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  28.5 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  29.16 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  38.18 
 
 		 553 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  28.4 
 
 		 748 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  26.06 
 
 		 567 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  30.36 
 
 		 637 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.08 
 
 		 603 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  26.26 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  28.72 
 
 		 519 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  30.77 
 
 		 523 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  40.45 
 
 		 582 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  26.12 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  26.95 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 432 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  31.49 
 
 		 469 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>