178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3191 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  100 
 
 
602 aa  1161    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  62.52 
 
 
603 aa  600  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  66.26 
 
 
714 aa  273  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.91 
 
 
530 aa  211  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  39.14 
 
 
580 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  36.95 
 
 
499 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  35.21 
 
 
535 aa  191  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  36.03 
 
 
584 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  36.95 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  34.88 
 
 
580 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  36.06 
 
 
551 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  34.24 
 
 
556 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  42.04 
 
 
628 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  30.47 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  31.08 
 
 
585 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  48.52 
 
 
605 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  34.54 
 
 
568 aa  140  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.33 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  32.97 
 
 
620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  35 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  46.51 
 
 
360 aa  110  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.13 
 
 
748 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  47.26 
 
 
521 aa  105  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  29.6 
 
 
516 aa  104  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  30.49 
 
 
488 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  40.82 
 
 
222 aa  98.2  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  30.49 
 
 
511 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  51.09 
 
 
480 aa  94  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  51.09 
 
 
480 aa  94  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  51.09 
 
 
480 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  29.03 
 
 
512 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  37.75 
 
 
567 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  37.75 
 
 
426 aa  90.9  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  43.75 
 
 
535 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  33.89 
 
 
443 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  34.44 
 
 
510 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  51.06 
 
 
524 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  40.16 
 
 
502 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  29.23 
 
 
523 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  51.06 
 
 
517 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  34.64 
 
 
443 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  50 
 
 
519 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  44.64 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  44.64 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  44.64 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  44.64 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  40.16 
 
 
561 aa  85.1  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  44.64 
 
 
578 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  43.75 
 
 
578 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  29.37 
 
 
484 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  29.37 
 
 
567 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40.16 
 
 
577 aa  83.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  41.13 
 
 
512 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  42.45 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  42.98 
 
 
578 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  42.98 
 
 
578 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  49 
 
 
498 aa  78.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  45.16 
 
 
519 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  42.14 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  46.24 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  36.26 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  41.13 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  26.44 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  48.35 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  42.86 
 
 
550 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  31.07 
 
 
464 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  42.98 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  26.02 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  35.75 
 
 
553 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  33.55 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  27.49 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  43.62 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  43.62 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  33.11 
 
 
432 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  41.94 
 
 
582 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  43.3 
 
 
546 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  42.55 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  42.55 
 
 
508 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  38.14 
 
 
473 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  40.22 
 
 
532 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  31.4 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  34.03 
 
 
546 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  25.35 
 
 
405 aa  65.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  42.55 
 
 
514 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  42.55 
 
 
516 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  42.55 
 
 
491 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  42.55 
 
 
491 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  42.55 
 
 
491 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  30.86 
 
 
411 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  35.11 
 
 
485 aa  64.3  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  34.27 
 
 
561 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  30.86 
 
 
377 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  30.86 
 
 
377 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  29.82 
 
 
434 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  37.93 
 
 
427 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  34.46 
 
 
442 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  36.05 
 
 
423 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  31.72 
 
 
169 aa  63.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  35.11 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  40.48 
 
 
743 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>