97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1606 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  92.66 
 
 
411 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  92.62 
 
 
377 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  860    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  860    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  92.62 
 
 
377 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  71.89 
 
 
475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  71.5 
 
 
434 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  70.28 
 
 
434 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  70.28 
 
 
434 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  71.26 
 
 
424 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  66.75 
 
 
426 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  65.89 
 
 
430 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  65.68 
 
 
466 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  67.06 
 
 
430 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  65.19 
 
 
436 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  62.71 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  48.16 
 
 
547 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  46.68 
 
 
474 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  55.41 
 
 
457 aa  362  6e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  52.7 
 
 
479 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  63.44 
 
 
340 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  63.12 
 
 
268 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  46.92 
 
 
405 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  48.02 
 
 
441 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  45.9 
 
 
403 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  45.38 
 
 
405 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  47.03 
 
 
423 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  45.34 
 
 
410 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  45.24 
 
 
404 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  45.89 
 
 
437 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  46.79 
 
 
408 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  46.15 
 
 
404 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  37.87 
 
 
481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  37.14 
 
 
555 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  51.64 
 
 
256 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  34.96 
 
 
545 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  32.64 
 
 
494 aa  146  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  33.42 
 
 
541 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.65 
 
 
589 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  46.21 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  33.45 
 
 
510 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  25.89 
 
 
580 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  27.61 
 
 
556 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.13 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  27.47 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.27 
 
 
567 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  25.71 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  29.54 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  29.54 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  29.3 
 
 
480 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.69 
 
 
508 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.78 
 
 
620 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.81 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  24.81 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.22 
 
 
516 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.44 
 
 
568 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.56 
 
 
566 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.74 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.64 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.29 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  29.39 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  27.17 
 
 
488 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.42 
 
 
511 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  27.17 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  28.99 
 
 
628 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  31.1 
 
 
714 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  27.98 
 
 
585 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  27.22 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  31.37 
 
 
222 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  32.87 
 
 
584 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  32.52 
 
 
748 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30.61 
 
 
602 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  37.39 
 
 
553 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  27.06 
 
 
530 aa  56.6  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28.76 
 
 
605 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  41.76 
 
 
582 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  31.3 
 
 
603 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  34.9 
 
 
539 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.01 
 
 
498 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.41 
 
 
567 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  29.81 
 
 
637 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  40.66 
 
 
508 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  40.66 
 
 
508 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  26.05 
 
 
512 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  24.21 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  30.07 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  36 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  25.22 
 
 
360 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  24.86 
 
 
484 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  39.56 
 
 
508 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  39.56 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  39.56 
 
 
508 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  39.56 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  39.56 
 
 
516 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  39.56 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  39.56 
 
 
514 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  30.57 
 
 
469 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>