131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3187 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  86.35 
 
 		 405 aa  698    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  100 
 
 		 404 aa  800    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  84.41 
 
 		 403 aa  685    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  82.6 
 
 		 408 aa  645    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  84.73 
 
 		 404 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  83.62 
 
 		 405 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  64.45 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  48.55 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  48.55 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  44.5 
 
 		 475 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  44.44 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  48.26 
 
 		 424 aa  272  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  48.83 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  44.19 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  48.83 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  44.19 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  48.83 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  44.9 
 
 		 426 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  46.22 
 
 		 430 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  45.48 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  43.93 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  38.57 
 
 		 547 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  43.87 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  39.07 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  42.54 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  39.13 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  38.94 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  36.09 
 
 		 481 aa  213  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  38.56 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  51.52 
 
 		 268 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  40.75 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  36.9 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  45.33 
 
 		 256 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  31.02 
 
 		 594 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  31.98 
 
 		 555 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  37 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  30.64 
 
 		 589 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  29.22 
 
 		 541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  28.96 
 
 		 545 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  27.75 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  28.88 
 
 		 535 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.59 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.8 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.93 
 
 		 567 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.25 
 
 		 426 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  29.45 
 
 		 508 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  27.81 
 
 		 568 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.5 
 
 		 620 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  24.87 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.13 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  26.14 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.79 
 
 		 516 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  26.96 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.08 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.51 
 
 		 585 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  33.53 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.8 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  33.53 
 
 		 558 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  31.1 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  31.21 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  33.54 
 
 		 580 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  27.15 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  26.01 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.94 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.96 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.96 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  32.1 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  26.57 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.57 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.33 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.44 
 
 		 480 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  26.29 
 
 		 567 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  26.74 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.79 
 
 		 484 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  28.8 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  31.17 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  24.87 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  26.99 
 
 		 475 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  25.76 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  25.85 
 
 		 506 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  28.91 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.37 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  26.52 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  25.08 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  27.51 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  23.69 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  24.26 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  29.69 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  30.67 
 
 		 546 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  32.14 
 
 		 748 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  39.44 
 
 		 166 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  26.98 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  23.84 
 
 		 454 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  35.62 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  24.73 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  24.73 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  26.24 
 
 		 561 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>