162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0148 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  100 
 
 
748 aa  1447    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  58.75 
 
 
637 aa  515  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  51.49 
 
 
620 aa  131  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  46.36 
 
 
426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  50.36 
 
 
709 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  44.74 
 
 
567 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  49.26 
 
 
743 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  45.93 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  30.61 
 
 
584 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  32.38 
 
 
535 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  35.86 
 
 
510 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  45.93 
 
 
443 aa  114  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  39.59 
 
 
499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  30.38 
 
 
580 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  44.2 
 
 
605 aa  110  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  39.53 
 
 
628 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  38.66 
 
 
602 aa  109  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  41.03 
 
 
714 aa  109  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.36 
 
 
580 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  40.7 
 
 
553 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  43.07 
 
 
558 aa  108  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  45.9 
 
 
551 aa  107  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  42.42 
 
 
516 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  41.42 
 
 
512 aa  104  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  36.15 
 
 
556 aa  104  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  40.15 
 
 
169 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  40.91 
 
 
565 aa  102  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  40.27 
 
 
566 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  42.86 
 
 
620 aa  100  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  39.49 
 
 
484 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  36.18 
 
 
603 aa  97.8  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  39.49 
 
 
567 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  40.48 
 
 
585 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  41.27 
 
 
568 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  51.22 
 
 
539 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  38.35 
 
 
198 aa  93.6  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  46.46 
 
 
310 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  48.31 
 
 
582 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  35.98 
 
 
512 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  45.69 
 
 
550 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  50.56 
 
 
508 aa  92  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  50.56 
 
 
508 aa  92  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  49.44 
 
 
508 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  49.44 
 
 
508 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  49.44 
 
 
514 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  49.44 
 
 
491 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  49.44 
 
 
491 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  49.44 
 
 
491 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  49.44 
 
 
516 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  32.76 
 
 
578 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  32.76 
 
 
578 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  49.44 
 
 
593 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  33.33 
 
 
578 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  49.44 
 
 
601 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  44.14 
 
 
521 aa  89.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  48.31 
 
 
601 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  44.33 
 
 
519 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  32.76 
 
 
578 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  38.26 
 
 
523 aa  88.2  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  48.31 
 
 
571 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  34.48 
 
 
507 aa  87.8  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  45.65 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  40.41 
 
 
502 aa  86.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  45.65 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  47.19 
 
 
532 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  43.08 
 
 
577 aa  85.5  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  48.81 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  48.81 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  48.81 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  42.31 
 
 
561 aa  85.1  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  45.65 
 
 
593 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  45.65 
 
 
593 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  46.25 
 
 
506 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  46.07 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  47.19 
 
 
586 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  45.98 
 
 
519 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  45.98 
 
 
524 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  45.98 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  42.39 
 
 
535 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  35.17 
 
 
508 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  34.16 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  36.88 
 
 
360 aa  80.1  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  40.88 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  45.33 
 
 
117 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  51.52 
 
 
434 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  45.68 
 
 
516 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  46.43 
 
 
511 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  46.43 
 
 
488 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  38.94 
 
 
222 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  34.27 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  50 
 
 
427 aa  73.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  36.07 
 
 
407 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  39.33 
 
 
546 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  36.3 
 
 
566 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34 
 
 
519 aa  67.8  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  34.08 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  41.94 
 
 
131 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  31.48 
 
 
473 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  36.8 
 
 
413 aa  64.7  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  45.21 
 
 
620 aa  64.7  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>