124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2758 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  869    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  43.81 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  43.97 
 
 		 547 aa  343  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  47.66 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  47.66 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  47.43 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  49.08 
 
 		 475 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  49.64 
 
 		 411 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  51.48 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  47 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  47 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  48.85 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  45.12 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  49.87 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  49.87 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  46.34 
 
 		 436 aa  317  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  49.88 
 
 		 479 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  46.52 
 
 		 426 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  45.5 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  44.58 
 
 		 430 aa  299  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  43.09 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  45.19 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  44.74 
 
 		 437 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  39.56 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  38.77 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  38.96 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  40.9 
 
 		 405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  39.65 
 
 		 410 aa  225  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  41.36 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  38.89 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  47.88 
 
 		 268 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  36.03 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  42.01 
 
 		 340 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  50.68 
 
 		 256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  35.51 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  33.94 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  31.31 
 
 		 545 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  33.26 
 
 		 589 aa  156  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 594 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  32.13 
 
 		 541 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  29.34 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.75 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  27.78 
 
 		 568 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  26.7 
 
 		 620 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25.46 
 
 		 556 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  28.26 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.2 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.08 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.23 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  31.11 
 
 		 443 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  28.36 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.41 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.41 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.55 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  24.27 
 
 		 551 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  26.49 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.52 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.82 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  33.54 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.1 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.08 
 
 		 628 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  31.27 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  30.36 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  29.34 
 
 		 516 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.18 
 
 		 714 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.49 
 
 		 480 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  39.77 
 
 		 593 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  39.77 
 
 		 601 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28.33 
 
 		 605 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.22 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.22 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  28.9 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  28.9 
 
 		 567 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  38.64 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  38.64 
 
 		 571 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  36.78 
 
 		 514 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  26.78 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  39.08 
 
 		 508 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  39.08 
 
 		 508 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  37.5 
 
 		 582 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  28.53 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  29.95 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  27.71 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  28.18 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  28.7 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  37.93 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  28.7 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  37.93 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  25.74 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  37.93 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  28.93 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  37.21 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  28.1 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.82 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  30.56 
 
 		 618 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  27.38 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  28.66 
 
 		 580 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.88 
 
 		 558 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  27.92 
 
 		 519 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  25.12 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>