85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07870 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1085    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  60.79 
 
 		 594 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  35.86 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  36.57 
 
 		 434 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  39.07 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  39.07 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  38.61 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  33.48 
 
 		 547 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  35.82 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  35.82 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  38.57 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  38.57 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  35.68 
 
 		 479 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  34.83 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  34.61 
 
 		 494 aa  186  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  37.47 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  36.36 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  36.75 
 
 		 589 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  37.14 
 
 		 475 aa  178  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  33.91 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  33.84 
 
 		 426 aa  177  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  33.51 
 
 		 541 aa  173  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  31.9 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  31.98 
 
 		 426 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  31.5 
 
 		 430 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  32 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  37.93 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  32.22 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  32.44 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  36.67 
 
 		 441 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  34.7 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  33.63 
 
 		 423 aa  160  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  34.37 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  33.08 
 
 		 408 aa  156  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  31.69 
 
 		 410 aa  154  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  31.98 
 
 		 404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  37.77 
 
 		 256 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  39.15 
 
 		 268 aa  120  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  29.47 
 
 		 340 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  29.55 
 
 		 567 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  30.19 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.13 
 
 		 580 aa  86.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.76 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.26 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.5 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  24.03 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  24.06 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.89 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  27.82 
 
 		 568 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.11 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  23.97 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29.7 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.93 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  23.88 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 603 aa  63.9  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  23.58 
 
 		 530 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  26.05 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  32.72 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 748 aa  60.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.96 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  26.05 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  33.11 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  29.44 
 
 		 628 aa  58.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  28.49 
 
 		 580 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 605 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.46 
 
 		 516 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 637 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  31.75 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  31.75 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  31.75 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.67 
 
 		 512 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  29.09 
 
 		 222 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  35.14 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  29.1 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  59.46 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  42.37 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  24.92 
 
 		 567 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  32.14 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  42.37 
 
 		 511 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.44 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 432 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  29.48 
 
 		 521 aa  43.9  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  35.42 
 
 		 437 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 586 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>