89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0290 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  99.2 
 
 
377 aa  755    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  92.66 
 
 
430 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  818    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  92.66 
 
 
430 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  99.2 
 
 
377 aa  755    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  75.57 
 
 
475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  73.82 
 
 
434 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  73.82 
 
 
434 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  73.82 
 
 
434 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  72.52 
 
 
424 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  68.01 
 
 
426 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  67.82 
 
 
430 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  68.83 
 
 
430 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  68.06 
 
 
466 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  66.67 
 
 
436 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  64.34 
 
 
426 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  54.73 
 
 
457 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  47.24 
 
 
547 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  46.17 
 
 
474 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  52.83 
 
 
479 aa  348  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  64.47 
 
 
340 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  67.81 
 
 
268 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  49.64 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  47.42 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  45.83 
 
 
403 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  45.34 
 
 
410 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  44.85 
 
 
405 aa  294  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  44.59 
 
 
404 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  46.68 
 
 
423 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  45.07 
 
 
437 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  45.74 
 
 
408 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  46.17 
 
 
404 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  38.07 
 
 
481 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  37.5 
 
 
555 aa  200  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  51.17 
 
 
256 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  34.72 
 
 
494 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  34.53 
 
 
545 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  33.33 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  32.36 
 
 
589 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  47.59 
 
 
594 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  29.59 
 
 
510 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.53 
 
 
556 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.98 
 
 
567 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  24.72 
 
 
580 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.23 
 
 
499 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  25.99 
 
 
508 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.16 
 
 
426 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.01 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  24.54 
 
 
535 aa  83.2  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  23.92 
 
 
558 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  26.73 
 
 
620 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.83 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.84 
 
 
566 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.96 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  24.71 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.44 
 
 
568 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.26 
 
 
516 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  29.63 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  28.04 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  28.04 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  27.73 
 
 
512 aa  69.7  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  27.79 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30.86 
 
 
602 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  32.22 
 
 
714 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  29.59 
 
 
628 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.09 
 
 
511 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  27.83 
 
 
488 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28.72 
 
 
605 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  26.95 
 
 
580 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  30.72 
 
 
222 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  28.57 
 
 
584 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  27.06 
 
 
530 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.71 
 
 
498 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  27.89 
 
 
585 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  38.18 
 
 
553 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  28.4 
 
 
748 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  26.4 
 
 
567 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  30.99 
 
 
637 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.08 
 
 
603 aa  53.5  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  26.61 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  29.41 
 
 
519 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  40.45 
 
 
582 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  30.77 
 
 
523 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  26.12 
 
 
360 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  27.36 
 
 
539 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  37.5 
 
 
432 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  24.72 
 
 
512 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  38.27 
 
 
571 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  31.09 
 
 
469 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>