83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2586 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  82.86 
 
 
426 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  866    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  78.27 
 
 
430 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  76.2 
 
 
466 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  74.06 
 
 
426 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  73.41 
 
 
436 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  70.75 
 
 
434 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  70.75 
 
 
434 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  70.75 
 
 
434 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  97.76 
 
 
268 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  67.06 
 
 
430 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  67.06 
 
 
430 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  68.83 
 
 
411 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  70.6 
 
 
377 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  70.6 
 
 
377 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  60.28 
 
 
475 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  74.92 
 
 
340 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  60.33 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  44.03 
 
 
474 aa  320  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  43.49 
 
 
547 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  49.61 
 
 
457 aa  306  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  47.38 
 
 
479 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  44.74 
 
 
403 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  45.5 
 
 
441 aa  280  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  43.75 
 
 
404 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  43.96 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  45.61 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  43.59 
 
 
410 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  42.36 
 
 
423 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  43.68 
 
 
408 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  44.76 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  42.01 
 
 
437 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  33.5 
 
 
481 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  31.24 
 
 
555 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  43.17 
 
 
256 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  31.55 
 
 
594 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  32.05 
 
 
494 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  30.67 
 
 
545 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  32.41 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  30.93 
 
 
589 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  29.97 
 
 
510 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.89 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.81 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.13 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  32.12 
 
 
628 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  23.99 
 
 
580 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.69 
 
 
508 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.46 
 
 
556 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.17 
 
 
516 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.01 
 
 
714 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  25.07 
 
 
535 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  23.94 
 
 
566 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.2 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.44 
 
 
620 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  23.84 
 
 
507 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  25.61 
 
 
568 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  38.33 
 
 
553 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  27.78 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  34.13 
 
 
551 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  32.3 
 
 
530 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.99 
 
 
748 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.12 
 
 
488 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.12 
 
 
511 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  27.25 
 
 
567 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  26.84 
 
 
585 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.12 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.63 
 
 
480 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30.3 
 
 
602 aa  53.5  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.09 
 
 
605 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.91 
 
 
480 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.91 
 
 
480 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.39 
 
 
584 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  26.59 
 
 
484 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  29.34 
 
 
580 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  29.34 
 
 
558 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  31.91 
 
 
222 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.22 
 
 
512 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  26.84 
 
 
498 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  31.3 
 
 
603 aa  46.6  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  30.56 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  23.85 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.06 
 
 
637 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  38.37 
 
 
582 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>