132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3596 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  72.87 
 
 
473 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  45.06 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  45.79 
 
 
488 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  39.47 
 
 
506 aa  299  8e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  42.17 
 
 
480 aa  289  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  42.17 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  42.17 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  37.06 
 
 
512 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  37.76 
 
 
514 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  36.31 
 
 
546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  36.98 
 
 
535 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  37.61 
 
 
508 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  37.61 
 
 
508 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  38.68 
 
 
508 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  38.68 
 
 
508 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  38.28 
 
 
517 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  37.4 
 
 
519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  37.4 
 
 
491 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  37.4 
 
 
491 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  37.2 
 
 
491 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  37.82 
 
 
516 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  39.95 
 
 
567 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  39.22 
 
 
550 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  39.59 
 
 
519 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  40.84 
 
 
484 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  37.47 
 
 
524 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  34.84 
 
 
532 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  45.89 
 
 
441 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  45.67 
 
 
578 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  45.67 
 
 
578 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  44.23 
 
 
578 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  44.23 
 
 
578 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  45.5 
 
 
581 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  45.5 
 
 
581 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  45.5 
 
 
593 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  45.5 
 
 
593 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  46.49 
 
 
516 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  31.49 
 
 
519 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  43.98 
 
 
582 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  35.93 
 
 
539 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  42.99 
 
 
593 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  43.01 
 
 
601 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  44.9 
 
 
601 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  38.58 
 
 
550 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  41.05 
 
 
571 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  44.32 
 
 
586 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  40.89 
 
 
620 aa  127  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  28.99 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.44 
 
 
426 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  29.72 
 
 
535 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  26.48 
 
 
579 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.57 
 
 
567 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.25 
 
 
580 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  30.8 
 
 
475 aa  96.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  28.47 
 
 
499 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  29.2 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  29.72 
 
 
618 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.01 
 
 
556 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  35.57 
 
 
530 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.88 
 
 
628 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.33 
 
 
748 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.11 
 
 
443 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.83 
 
 
516 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.69 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  39.13 
 
 
558 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  39.13 
 
 
584 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  44.68 
 
 
635 aa  73.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  38.26 
 
 
580 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  31.19 
 
 
602 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  27.45 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  25.8 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  28.51 
 
 
566 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  36.07 
 
 
709 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.63 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  39.08 
 
 
743 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  40.23 
 
 
620 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  25.53 
 
 
510 aa  66.6  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  30.43 
 
 
637 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  24.17 
 
 
457 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  24.69 
 
 
404 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  26.75 
 
 
408 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  30.95 
 
 
714 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  25.19 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  32.5 
 
 
603 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.23 
 
 
620 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  24.4 
 
 
508 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  26.11 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  24.38 
 
 
403 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  24.4 
 
 
423 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  35.16 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  32.65 
 
 
535 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  40.66 
 
 
122 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  31.97 
 
 
585 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  24.88 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  31.1 
 
 
553 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  25.06 
 
 
502 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  35.35 
 
 
498 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  25.82 
 
 
481 aa  56.6  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  34.07 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>