121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3778 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  961    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  73.71 
 
 
464 aa  628  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  46.42 
 
 
511 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  47 
 
 
488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  41.74 
 
 
480 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  41.74 
 
 
480 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  41.74 
 
 
480 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  39.4 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  38.24 
 
 
512 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  39.84 
 
 
514 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  39.92 
 
 
508 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  39.92 
 
 
508 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  37.45 
 
 
535 aa  263  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  40.12 
 
 
508 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  40.12 
 
 
508 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  36.67 
 
 
546 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  38.66 
 
 
491 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  38.86 
 
 
491 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  38.86 
 
 
491 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  38.96 
 
 
517 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  39.71 
 
 
516 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  42.74 
 
 
567 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  38.36 
 
 
519 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  38.42 
 
 
524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  42.19 
 
 
484 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  36.4 
 
 
532 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  40.2 
 
 
550 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  39.23 
 
 
519 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  45.99 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  50.24 
 
 
578 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  49.76 
 
 
578 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  48.31 
 
 
578 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  48.31 
 
 
578 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  50.24 
 
 
593 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  50.24 
 
 
593 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  49.05 
 
 
581 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  49.05 
 
 
581 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  50.77 
 
 
582 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  38.78 
 
 
539 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  49.48 
 
 
601 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  45.03 
 
 
516 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  45.54 
 
 
571 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  45.7 
 
 
593 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  46.43 
 
 
601 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  48.11 
 
 
586 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  30.63 
 
 
519 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  42.86 
 
 
550 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  44.28 
 
 
620 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  27 
 
 
566 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.25 
 
 
426 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.4 
 
 
567 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  26.43 
 
 
579 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.18 
 
 
580 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  29.52 
 
 
535 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  28.57 
 
 
475 aa  90.5  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  29.66 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  28.67 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.73 
 
 
516 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  32.81 
 
 
637 aa  77  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  27.43 
 
 
499 aa  77  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.26 
 
 
556 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  26.03 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.9 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  27.47 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.29 
 
 
512 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  25.49 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.98 
 
 
628 aa  70.5  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  25.86 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  25.89 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  36.97 
 
 
620 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  26.3 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  41.49 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  40.18 
 
 
605 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  37.5 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  24.68 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.21 
 
 
709 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  37.93 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  24.15 
 
 
510 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.67 
 
 
580 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  31.48 
 
 
748 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  38.14 
 
 
602 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  41 
 
 
122 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  26 
 
 
437 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  35.94 
 
 
498 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  36.84 
 
 
714 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  27.9 
 
 
566 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  40.98 
 
 
743 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  23.66 
 
 
457 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  37 
 
 
535 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  28.18 
 
 
620 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.28 
 
 
508 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  24.15 
 
 
405 aa  60.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  37.36 
 
 
434 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.64 
 
 
568 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  26.74 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  24.14 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  46.77 
 
 
603 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  23.23 
 
 
403 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  22.96 
 
 
479 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  33.77 
 
 
169 aa  56.6  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>