113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1180 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  73.55 
 
 
535 aa  728    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  88.78 
 
 
524 aa  846    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1048    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  93.23 
 
 
517 aa  907    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  49.4 
 
 
581 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  49.4 
 
 
581 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  49.57 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  55.2 
 
 
516 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  41.26 
 
 
512 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  40.89 
 
 
539 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  40.11 
 
 
511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  44.3 
 
 
550 aa  336  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  41.39 
 
 
508 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  41.39 
 
 
508 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  43.23 
 
 
506 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  41.64 
 
 
514 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  41.51 
 
 
550 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  42.16 
 
 
480 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  42.16 
 
 
480 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  41.75 
 
 
480 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  40.36 
 
 
546 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  42.07 
 
 
488 aa  320  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  41.62 
 
 
491 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  41.62 
 
 
491 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  41.62 
 
 
491 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  42.69 
 
 
519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  40.82 
 
 
516 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  39.89 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  39.89 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  39.15 
 
 
582 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  34.43 
 
 
571 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  39.04 
 
 
532 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  55.56 
 
 
578 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  55.56 
 
 
578 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  34.83 
 
 
586 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  55.56 
 
 
593 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  55.56 
 
 
593 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  55.56 
 
 
578 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  38.64 
 
 
464 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  37.54 
 
 
620 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  38.28 
 
 
473 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  42.94 
 
 
441 aa  237  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  36.8 
 
 
484 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  34.53 
 
 
567 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  45.12 
 
 
601 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  43.55 
 
 
593 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  40.08 
 
 
601 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  29.48 
 
 
579 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  27.95 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  36.3 
 
 
618 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  28.94 
 
 
519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  37.05 
 
 
475 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  53.26 
 
 
122 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  50.59 
 
 
620 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.3 
 
 
516 aa  87.8  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  50 
 
 
602 aa  87.4  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  47.67 
 
 
709 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  44.57 
 
 
748 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  43.18 
 
 
743 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  44.9 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  46.32 
 
 
714 aa  80.1  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  45.98 
 
 
637 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  30.41 
 
 
530 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  43.88 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  44.09 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.64 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  28.95 
 
 
586 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  40.82 
 
 
567 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  30.2 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  58.33 
 
 
603 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  45.74 
 
 
635 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  38.21 
 
 
499 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  41.24 
 
 
498 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  43.82 
 
 
117 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  39.78 
 
 
565 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  41.94 
 
 
198 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  40.91 
 
 
605 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  39.22 
 
 
628 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  38.33 
 
 
510 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  28.35 
 
 
512 aa  63.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  35.51 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  42.86 
 
 
620 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  44.79 
 
 
551 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  35.51 
 
 
427 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  37.88 
 
 
568 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.61 
 
 
580 aa  60.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  43.16 
 
 
556 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  43.01 
 
 
566 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  28.12 
 
 
535 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  30.57 
 
 
558 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  41.11 
 
 
585 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  50 
 
 
580 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  45 
 
 
131 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  50 
 
 
584 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  40.91 
 
 
129 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  37.11 
 
 
169 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  43.06 
 
 
360 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  37.37 
 
 
572 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  37.37 
 
 
557 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  37.37 
 
 
602 aa  51.2  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>