110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3627 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  100 
 
 
743 aa  1407    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  54.96 
 
 
620 aa  228  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  59.93 
 
 
709 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  47.08 
 
 
637 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  45.3 
 
 
748 aa  132  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  52.38 
 
 
512 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  50 
 
 
539 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  42.15 
 
 
582 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  41.22 
 
 
601 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  41.22 
 
 
571 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  37.18 
 
 
512 aa  85.1  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  45.88 
 
 
519 aa  84  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  41.22 
 
 
593 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  48.39 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  48.39 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  41.22 
 
 
601 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  47.31 
 
 
491 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  47.31 
 
 
491 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  47.31 
 
 
491 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  47.31 
 
 
514 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  47.31 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  41.04 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  47.31 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  47.31 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  47.87 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  43.18 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  43.18 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  44.32 
 
 
581 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  44.32 
 
 
581 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  43.18 
 
 
517 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  45.88 
 
 
550 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  44.32 
 
 
578 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  37.98 
 
 
499 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  42.05 
 
 
535 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  45.12 
 
 
506 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  36.2 
 
 
567 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  41.94 
 
 
551 aa  78.2  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  43.18 
 
 
578 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  44.32 
 
 
593 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  44.32 
 
 
593 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  37.6 
 
 
584 aa  77.8  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  48.72 
 
 
550 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  36.81 
 
 
443 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  44.71 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  44.71 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  44.71 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  34.88 
 
 
516 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  36 
 
 
580 aa  76.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  36.8 
 
 
580 aa  75.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  34.03 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  34.03 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  47.78 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  37.6 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  35.48 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  37.72 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  37.01 
 
 
530 aa  75.1  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  36.73 
 
 
426 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40.68 
 
 
628 aa  73.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  39.8 
 
 
516 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  50 
 
 
511 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  50 
 
 
488 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  42.55 
 
 
519 aa  72.4  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  40.16 
 
 
510 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  36.11 
 
 
443 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  33.33 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  33.33 
 
 
567 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  45.83 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  39.08 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  38.24 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  32.95 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  39.29 
 
 
546 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  41.57 
 
 
434 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  35.54 
 
 
585 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  39.08 
 
 
714 aa  65.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  35.56 
 
 
198 aa  65.1  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  45.35 
 
 
535 aa  65.1  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  32.64 
 
 
556 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  32.85 
 
 
502 aa  63.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  40.48 
 
 
602 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.81 
 
 
565 aa  62.4  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  40.98 
 
 
473 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  34.97 
 
 
508 aa  61.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  40.45 
 
 
427 aa  61.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  33.88 
 
 
566 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  56.86 
 
 
117 aa  60.1  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  41.33 
 
 
620 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  32.5 
 
 
620 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  38.46 
 
 
618 aa  58.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  33.06 
 
 
568 aa  58.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  33.16 
 
 
481 aa  58.2  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  39.53 
 
 
521 aa  57.4  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  39.29 
 
 
523 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  30.97 
 
 
408 aa  55.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  33.88 
 
 
603 aa  55.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  29.65 
 
 
594 aa  55.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  32.31 
 
 
413 aa  55.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  31.88 
 
 
222 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  42.17 
 
 
635 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  38.27 
 
 
485 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  36.89 
 
 
442 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>