50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10401 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  100 
 
 
122 aa  244  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  85.45 
 
 
441 aa  187  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  59.82 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  59.82 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  45.26 
 
 
535 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  50 
 
 
517 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  41.91 
 
 
516 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  53.12 
 
 
524 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  53.76 
 
 
593 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  53.76 
 
 
581 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  53.76 
 
 
593 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  53.76 
 
 
581 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  47.86 
 
 
519 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  54.35 
 
 
578 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  51.61 
 
 
578 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  53.26 
 
 
578 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  53.26 
 
 
578 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  58.51 
 
 
480 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  58.51 
 
 
480 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  58.51 
 
 
480 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  50 
 
 
512 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  52.81 
 
 
550 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  66.67 
 
 
539 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  40.6 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  40.17 
 
 
593 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  40 
 
 
586 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  46.59 
 
 
532 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  42.64 
 
 
506 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  40.68 
 
 
519 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  45.45 
 
 
571 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  44.32 
 
 
601 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  44.32 
 
 
601 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  45.45 
 
 
582 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  43.33 
 
 
491 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  45.35 
 
 
516 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  45.35 
 
 
514 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  43.33 
 
 
491 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  43.33 
 
 
491 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  45.35 
 
 
508 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  45.35 
 
 
508 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  45.35 
 
 
508 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  43.33 
 
 
550 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  45.35 
 
 
508 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  41 
 
 
473 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  41.25 
 
 
464 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  57.14 
 
 
484 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  57.14 
 
 
567 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  44.21 
 
 
620 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  43.55 
 
 
566 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>