128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0314 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  68.65 
 
 
539 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  100 
 
 
512 aa  1035    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  45.37 
 
 
550 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  41.26 
 
 
581 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  41.26 
 
 
581 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  48.02 
 
 
550 aa  362  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  40.92 
 
 
593 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  40.92 
 
 
593 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  41.11 
 
 
578 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  40.54 
 
 
578 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  46.87 
 
 
519 aa  347  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  41.59 
 
 
535 aa  343  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  42.02 
 
 
519 aa  336  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  42.09 
 
 
524 aa  334  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  41.58 
 
 
517 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  42.51 
 
 
511 aa  330  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  43.23 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  40.97 
 
 
480 aa  309  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  40.97 
 
 
480 aa  309  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  40.57 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  39.4 
 
 
514 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  38.6 
 
 
508 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  38.6 
 
 
508 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  37.81 
 
 
506 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  37.87 
 
 
582 aa  287  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  38.4 
 
 
508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  38.4 
 
 
508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  37.89 
 
 
491 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  37.89 
 
 
491 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  37.89 
 
 
491 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  37.06 
 
 
601 aa  279  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  38 
 
 
516 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  36.98 
 
 
586 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  35.44 
 
 
593 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  34.1 
 
 
601 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  36.58 
 
 
571 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  36.08 
 
 
546 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  36.2 
 
 
532 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  38.36 
 
 
464 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  39.35 
 
 
473 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  44.81 
 
 
516 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  44.19 
 
 
441 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  34.95 
 
 
567 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  35.14 
 
 
484 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  38.43 
 
 
578 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  38.43 
 
 
578 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  45.45 
 
 
620 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  30.98 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  28.06 
 
 
579 aa  124  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  29.85 
 
 
519 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  56.79 
 
 
620 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  54.88 
 
 
709 aa  97.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  52.38 
 
 
743 aa  96.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.72 
 
 
567 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  46.46 
 
 
748 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  48.96 
 
 
637 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.33 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.02 
 
 
426 aa  87  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  44.68 
 
 
443 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30.95 
 
 
602 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  48.35 
 
 
714 aa  84.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.91 
 
 
499 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.61 
 
 
580 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  50 
 
 
122 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  30.31 
 
 
618 aa  80.9  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  45.54 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  47.19 
 
 
565 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  30.86 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  27.34 
 
 
530 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  28.78 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  46.07 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  36.49 
 
 
628 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  27.67 
 
 
558 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  33.16 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  32.58 
 
 
551 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  39.64 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  36.73 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  40.87 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  38.33 
 
 
117 aa  70.5  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  36.22 
 
 
605 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  48.65 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  44.44 
 
 
635 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  28.25 
 
 
556 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  35 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.89 
 
 
568 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  40.86 
 
 
169 aa  64.3  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  42.86 
 
 
580 aa  63.9  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.12 
 
 
585 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  42.86 
 
 
584 aa  63.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  28.15 
 
 
566 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  37.12 
 
 
620 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  25.83 
 
 
508 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  39.78 
 
 
516 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  48.15 
 
 
131 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  24.38 
 
 
502 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  32.86 
 
 
507 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  24.58 
 
 
521 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  26.76 
 
 
437 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  25.9 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  31.74 
 
 
504 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>