102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3127 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  100 
 
 
474 aa  949    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  81.19 
 
 
547 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  60.24 
 
 
457 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  60.74 
 
 
479 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  47.75 
 
 
475 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  46.68 
 
 
430 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  46.68 
 
 
430 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  46.73 
 
 
434 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  46.4 
 
 
411 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  46.5 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  46.5 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  47.17 
 
 
377 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  47.17 
 
 
377 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  47.2 
 
 
424 aa  322  6e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  45.18 
 
 
430 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  44.11 
 
 
426 aa  300  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  43.78 
 
 
436 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  43.81 
 
 
441 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  43.78 
 
 
466 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  43.03 
 
 
430 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  42.39 
 
 
426 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  45.91 
 
 
423 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  40.93 
 
 
405 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  46.09 
 
 
437 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  39.53 
 
 
404 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  39.67 
 
 
403 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  38.69 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  38.5 
 
 
410 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  39.02 
 
 
408 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  37.47 
 
 
481 aa  236  8e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  39.07 
 
 
404 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  35.86 
 
 
555 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  44.12 
 
 
268 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  40.7 
 
 
340 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  46.09 
 
 
256 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  31.46 
 
 
594 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  33.67 
 
 
589 aa  160  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  33.43 
 
 
494 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  33.33 
 
 
545 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  31.97 
 
 
541 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.73 
 
 
580 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.4 
 
 
535 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.45 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  23.6 
 
 
566 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.87 
 
 
567 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  26.27 
 
 
620 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  26.24 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.12 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.36 
 
 
551 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  25.62 
 
 
568 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  30.52 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25.47 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.89 
 
 
426 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  30.25 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  30.8 
 
 
605 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.38 
 
 
628 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  24.07 
 
 
507 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  30.85 
 
 
558 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  23.41 
 
 
585 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.25 
 
 
584 aa  67  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.98 
 
 
480 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  32.41 
 
 
530 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.44 
 
 
480 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.44 
 
 
480 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  30.31 
 
 
443 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  25.96 
 
 
488 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.96 
 
 
511 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.92 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  26.9 
 
 
516 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  29.52 
 
 
714 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.06 
 
 
561 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  24.75 
 
 
473 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  34.67 
 
 
546 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  30.71 
 
 
748 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  28.98 
 
 
637 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  35.64 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  31.78 
 
 
603 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  31.5 
 
 
627 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  32.98 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  32.05 
 
 
572 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  25.7 
 
 
475 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  36.99 
 
 
418 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  36.26 
 
 
417 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  39.24 
 
 
620 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.19 
 
 
567 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  25.49 
 
 
577 aa  46.6  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  32.45 
 
 
553 aa  46.6  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  33.65 
 
 
408 aa  46.6  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.12 
 
 
484 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  36.99 
 
 
418 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.98 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  34.65 
 
 
546 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  28.12 
 
 
602 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  35.11 
 
 
321 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  28 
 
 
441 aa  44.3  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  36.62 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  25.42 
 
 
561 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  40.68 
 
 
535 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  26.52 
 
 
498 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  34.44 
 
 
407 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>