130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0390 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  85.71 
 
 		 408 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  85.68 
 
 		 403 aa  700    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  84.94 
 
 		 404 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  84.44 
 
 		 405 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  86.35 
 
 		 404 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  100 
 
 		 405 aa  806    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  66.06 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  49.71 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  49.71 
 
 		 430 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  45.76 
 
 		 475 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  50.29 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  50.29 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  50.29 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  48.55 
 
 		 424 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  43.85 
 
 		 434 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  43.59 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  43.59 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  46.36 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  46.49 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  44.61 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  44.51 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  45.32 
 
 		 426 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  43.38 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  38.89 
 
 		 547 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  38.69 
 
 		 474 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  38.96 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  39.28 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  51.53 
 
 		 268 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  35.34 
 
 		 481 aa  209  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  41.91 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  39.39 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  36.13 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  44.89 
 
 		 256 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  31.9 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 594 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  37.73 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  32.21 
 
 		 589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  32.15 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  30.03 
 
 		 494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  31.74 
 
 		 545 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  29.97 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.32 
 
 		 580 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  29.19 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.88 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.91 
 
 		 556 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.03 
 
 		 567 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  30.46 
 
 		 508 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  27.85 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  26.91 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  34.73 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.27 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  34.73 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  26.63 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  24.06 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  33.7 
 
 		 580 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.42 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  28.5 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  28.5 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  28.06 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.01 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.89 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  26.02 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  27.06 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.94 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  26.37 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.71 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  25.71 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.31 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  29.51 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.79 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.66 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.12 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  25.55 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  28.01 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.34 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  24.47 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  24.48 
 
 		 521 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  25.38 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.5 
 
 		 603 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  25.89 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  26.38 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  29.19 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  26.02 
 
 		 508 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  26.02 
 
 		 508 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  33.8 
 
 		 582 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  30.13 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  32.37 
 
 		 748 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 586 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  33.96 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  24.83 
 
 		 514 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  36.59 
 
 		 571 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  30.38 
 
 		 553 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  39.24 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  30.14 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  30.14 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>