76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1474 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  97.76 
 
 
430 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  82.09 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  74.06 
 
 
430 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  71.64 
 
 
466 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  69.96 
 
 
436 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  68.32 
 
 
426 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  67.18 
 
 
434 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  67.18 
 
 
434 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  67.18 
 
 
434 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  63.12 
 
 
430 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  63.12 
 
 
430 aa  321  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  67.81 
 
 
411 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  67.81 
 
 
377 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  67.81 
 
 
377 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  59.62 
 
 
475 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  56.44 
 
 
424 aa  284  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  51.87 
 
 
403 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  52.67 
 
 
404 aa  224  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  51.04 
 
 
405 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  51.04 
 
 
405 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  65.68 
 
 
340 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  50 
 
 
410 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  42.71 
 
 
547 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  49.79 
 
 
457 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  43.16 
 
 
474 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  47.64 
 
 
479 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  51.44 
 
 
404 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  51.04 
 
 
408 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  47.88 
 
 
441 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  43.16 
 
 
423 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  40.82 
 
 
437 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  43.69 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  36.44 
 
 
481 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  39.15 
 
 
555 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  35.71 
 
 
494 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  32.86 
 
 
594 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  35.1 
 
 
545 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  32.52 
 
 
589 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  38.16 
 
 
541 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  31.22 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.39 
 
 
567 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  29.24 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.52 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.33 
 
 
714 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  27.13 
 
 
556 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.65 
 
 
443 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  27.85 
 
 
508 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  38.33 
 
 
553 aa  59.3  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  33.07 
 
 
551 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  23.77 
 
 
499 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  25.48 
 
 
568 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.65 
 
 
443 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.68 
 
 
530 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.55 
 
 
748 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  26.84 
 
 
585 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.86 
 
 
620 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  28.16 
 
 
605 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  29.73 
 
 
566 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  29.35 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  28.48 
 
 
584 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  27.54 
 
 
580 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  31.89 
 
 
516 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30.3 
 
 
602 aa  52.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  24.5 
 
 
535 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  24.43 
 
 
580 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  28.86 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  27.21 
 
 
558 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  31.14 
 
 
567 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  31.14 
 
 
484 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  31.03 
 
 
603 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  32.64 
 
 
523 aa  45.8  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.14 
 
 
507 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  30.87 
 
 
637 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  28.34 
 
 
464 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  26.23 
 
 
360 aa  42  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>