92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4785 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  99.08 
 
 
434 aa  867    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  876    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  876    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  73.47 
 
 
426 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  73.72 
 
 
430 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  73.95 
 
 
436 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  72.01 
 
 
466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  70.75 
 
 
430 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  68.57 
 
 
426 aa  551  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  70.28 
 
 
430 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  70.28 
 
 
430 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  73.82 
 
 
411 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  75.55 
 
 
377 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  75.55 
 
 
377 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  64.06 
 
 
475 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  62.53 
 
 
424 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  69.49 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  69.08 
 
 
268 aa  348  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  46.5 
 
 
474 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  45.71 
 
 
547 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  47.77 
 
 
457 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  48.26 
 
 
479 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  47.1 
 
 
441 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  43.14 
 
 
404 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  43.59 
 
 
405 aa  279  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  43.93 
 
 
403 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  43.85 
 
 
405 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  47.42 
 
 
423 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  42.08 
 
 
410 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  44.48 
 
 
437 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  44.5 
 
 
408 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  44.19 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  34.43 
 
 
481 aa  207  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  35.96 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  49.53 
 
 
256 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  31.26 
 
 
594 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  32.49 
 
 
494 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  33.07 
 
 
545 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.05 
 
 
589 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  31.47 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  29.87 
 
 
510 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.34 
 
 
499 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  26.02 
 
 
580 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.04 
 
 
535 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.78 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.54 
 
 
567 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.47 
 
 
551 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.49 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25 
 
 
556 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  24.77 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  27.36 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  27.66 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  31.4 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  28.36 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  28.93 
 
 
558 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  28.36 
 
 
511 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  27.32 
 
 
516 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  27.81 
 
 
580 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  24.62 
 
 
508 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  38.6 
 
 
553 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  31.25 
 
 
584 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.54 
 
 
512 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  30.95 
 
 
605 aa  63.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.34 
 
 
568 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  23.65 
 
 
620 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  29.24 
 
 
602 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  29.68 
 
 
714 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  27.53 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  24.48 
 
 
566 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  30.86 
 
 
748 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  28.8 
 
 
498 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  28.06 
 
 
603 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  25.71 
 
 
577 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  24.52 
 
 
480 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  25.63 
 
 
561 aa  53.5  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.55 
 
 
480 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.55 
 
 
480 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  26.61 
 
 
585 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  24.86 
 
 
567 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  30 
 
 
637 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  24.79 
 
 
484 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  23.98 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  27.7 
 
 
523 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  38.78 
 
 
535 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  36.23 
 
 
173 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  36.23 
 
 
171 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  26.23 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  39.08 
 
 
635 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  35.62 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  33 
 
 
473 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  27.83 
 
 
469 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  28.92 
 
 
222 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>