104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1140 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  86.73 
 
 		 408 aa  661    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  83.62 
 
 		 404 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  93.83 
 
 		 403 aa  749    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  84.44 
 
 		 405 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  86.42 
 
 		 404 aa  701    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  100 
 
 		 405 aa  805    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  67.1 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  47.88 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  47.88 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  44.1 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  44.73 
 
 		 475 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  43.85 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  43.85 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  47.29 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  47.73 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  47.29 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  47.29 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  46.65 
 
 		 436 aa  273  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  44.82 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  41.31 
 
 		 547 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  45.3 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  40.93 
 
 		 474 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  44.44 
 
 		 426 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  43.17 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  43.79 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  39.07 
 
 		 479 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  40.83 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  51.09 
 
 		 268 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  36.34 
 
 		 481 aa  210  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  40.9 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  40.52 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  37.87 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  44.89 
 
 		 256 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  38.3 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  32 
 
 		 555 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.46 
 
 		 589 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  31.65 
 
 		 541 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  42.47 
 
 		 594 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  29.03 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  30.54 
 
 		 545 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.95 
 
 		 580 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  28.61 
 
 		 535 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.84 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  28.25 
 
 		 567 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  29.72 
 
 		 508 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  28.09 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.67 
 
 		 568 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.91 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.21 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.96 
 
 		 566 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  25.13 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.48 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.6 
 
 		 551 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  30.03 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  31.15 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.39 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  29.94 
 
 		 584 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  31.63 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  25.69 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.48 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  29.73 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  34.06 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  30.56 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 714 aa  60.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.4 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.4 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.4 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  24.92 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  24.88 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  30.94 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.29 
 
 		 511 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  25.29 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  26.72 
 
 		 498 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  41.77 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  26.5 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 561 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  25.65 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  40.51 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  25.91 
 
 		 454 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  25.13 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 546 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  29.38 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.29 
 
 		 485 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  23.53 
 
 		 567 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2304  HNH endonuclease  30.86 
 
 		 105 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 321 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  28.38 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  29.56 
 
 		 572 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  24.01 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  31.39 
 
 		 561 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  25.08 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  25.08 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  35.16 
 
 		 582 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  23.22 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  31.39 
 
 		 577 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  30.88 
 
 		 661 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  31.11 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  35.62 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>