95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4725 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  870    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  73.24 
 
 
434 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  73.47 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  74.65 
 
 
430 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  73.47 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  72.89 
 
 
466 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  72.07 
 
 
436 aa  590  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  74.06 
 
 
430 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  72.38 
 
 
426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  66.75 
 
 
430 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  66.75 
 
 
430 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  68.01 
 
 
411 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  61.89 
 
 
475 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  69.44 
 
 
377 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  69.44 
 
 
377 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  62.59 
 
 
424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  70.69 
 
 
340 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  68.32 
 
 
268 aa  359  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  43.22 
 
 
474 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  42.09 
 
 
547 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  48.82 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  45.12 
 
 
441 aa  288  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  45.26 
 
 
479 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  43.15 
 
 
403 aa  276  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  41.85 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  42.32 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  43.36 
 
 
423 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  41.01 
 
 
405 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  41.26 
 
 
437 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  43.19 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  40.36 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  42.15 
 
 
408 aa  243  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  33.92 
 
 
481 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  46.9 
 
 
256 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  33.08 
 
 
555 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  34.29 
 
 
545 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  32.83 
 
 
541 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  30.68 
 
 
494 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  30.08 
 
 
589 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  44.14 
 
 
594 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  30.56 
 
 
510 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  25.93 
 
 
580 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.76 
 
 
567 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.76 
 
 
426 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  25.61 
 
 
551 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  25.14 
 
 
499 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  29.76 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  30.14 
 
 
310 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.35 
 
 
535 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.94 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  30.46 
 
 
628 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25.62 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.36 
 
 
516 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  24.85 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.73 
 
 
620 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.32 
 
 
568 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  23.32 
 
 
507 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  24.86 
 
 
566 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.71 
 
 
488 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  29.94 
 
 
714 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  26.71 
 
 
511 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  29.33 
 
 
530 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  24.93 
 
 
512 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  27.78 
 
 
584 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.85 
 
 
567 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  32.1 
 
 
748 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  32.86 
 
 
558 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  26.92 
 
 
580 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  35.29 
 
 
553 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.49 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.63 
 
 
480 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  27.33 
 
 
602 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.27 
 
 
480 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.27 
 
 
480 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  27.78 
 
 
605 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  27.21 
 
 
585 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  27.23 
 
 
498 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  25.98 
 
 
521 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  25.07 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  39.53 
 
 
582 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  24.21 
 
 
577 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  26.09 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  38.37 
 
 
491 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  38.37 
 
 
514 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  25.55 
 
 
603 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  38.37 
 
 
491 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  38.37 
 
 
491 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  37.21 
 
 
508 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  34.25 
 
 
535 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  37.21 
 
 
508 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  38.37 
 
 
516 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  26.14 
 
 
222 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  37.21 
 
 
601 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  37.21 
 
 
593 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1807  HNH endonuclease  35.06 
 
 
148 aa  43.1  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.236677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>