123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3341 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  100 
 
 		 408 aa  812    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  85.71 
 
 		 403 aa  680    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  86.73 
 
 		 405 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  85.71 
 
 		 405 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  82.6 
 
 		 404 aa  643    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  84.69 
 
 		 404 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  66.16 
 
 		 410 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  48.16 
 
 		 430 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  48.16 
 
 		 430 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  45.48 
 
 		 475 aa  279  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  46.33 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  47.67 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  46.05 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  46.05 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  45.45 
 
 		 436 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  47.01 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  47.01 
 
 		 377 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  47.01 
 
 		 377 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  45.01 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  44.44 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  44.26 
 
 		 430 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  43.79 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  40.75 
 
 		 547 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  42.9 
 
 		 466 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  39.02 
 
 		 474 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  39.89 
 
 		 479 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  38.08 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  39.5 
 
 		 437 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  36.8 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  40.52 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  42.49 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  50.66 
 
 		 268 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  45.58 
 
 		 256 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  33.08 
 
 		 555 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 594 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  37.59 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.09 
 
 		 589 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  31.65 
 
 		 541 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  31.14 
 
 		 545 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  29.48 
 
 		 494 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.52 
 
 		 580 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  30.18 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  28.65 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.67 
 
 		 567 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  30.65 
 
 		 508 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.78 
 
 		 551 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.19 
 
 		 568 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  27.3 
 
 		 620 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.76 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  26.42 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.61 
 
 		 556 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  25.67 
 
 		 530 aa  83.2  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.48 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  34.13 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.79 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  34.5 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.48 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.67 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  33.95 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  35.33 
 
 		 605 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  30.03 
 
 		 443 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  27.48 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  27.48 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  29.32 
 
 		 310 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  36.5 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  26.63 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  26.63 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  27.11 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  29.71 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.04 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 714 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.62 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  24.6 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  27.08 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  32.37 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  31.79 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  28.27 
 
 		 498 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  24.54 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  25.61 
 
 		 502 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  24.06 
 
 		 523 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  25.92 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  33.03 
 
 		 485 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  24.77 
 
 		 521 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  26.12 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  27.19 
 
 		 475 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 561 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  30.7 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  28.18 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  28.18 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  32 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  28.57 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  29.49 
 
 		 446 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  24.64 
 
 		 561 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  29.49 
 
 		 492 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  29.03 
 
 		 473 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  25.26 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  29.03 
 
 		 444 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>